新华出版社的机构设置十分丰富，其组织架构包括多个核心部门。总编室作为出版社的决策核心，负责整体内容的策划和编辑。时政、新闻和画册图片编辑室则专注于各类专业内容的制作。此外，出版社设有三个综合编辑室，致力于图书的选题策划和编辑工作。
图书选题策划中心负责新项目的选择和推广，发行中心则负责图书的市场推广和销售，印制部则确保出版物的质量和生产效率。办公室、人事处和财务中心则分别负责日常行政管理、人力资源和财务核算，确保出版社的高效运营。
在社属单位方面，中国年鉴社是新华出版社的重要组成部分，它受国务院办公厅委托，编辑并公开发行国家级的中英文版《中华人民共和国年鉴》，面向全球读者。中国新闻书店作为全国唯一的“国”字号新闻专业书店，除了销售新华出版社的图书，还承担着读者服务部和邮购部的职责，为读者提供全面的服务。
新华出版社积极拓展国际交流，与全球各地的出版界、新闻工作者、摄影家、翻译家和作者保持着紧密的合作关系。与美国、英国、法国等国家以及香港、台湾等地区，新华出版社开展了一系列的合作出版和版权业务交流项目，推动了跨文化交流与合作的发展。
新华出版社始建于1979年，是新华社主管的以出版社科图书为主的综合性大型中央级出版社，主要编辑出版新闻、时政、国际、经济、文教类图书，画册、图片、挂历等艺术类图书和内部参考图书。受国务院办公厅的委托，还编辑出版国家级的中英文版《中华人民共和国年鉴》；出版发行《人居》期刊，编印具有权威性的政府机构名录和国内外工商企业名录。