吉大的冷门考研科目有哲学社会学院的宗教学专业、外国语学院的亚非语言文学、行政学院的电子商务及应急管理、数学学院的运筹学与控制论专业、生物与农业工程学院的农业生物环境与能源工程专业等。
1、宗教学专业
宗教学是一门普通高等学校本科专业，属哲学类专业，基本修业年限为四年，授予哲学学士学位，是国家控制布点的专业。该专业要求学生学习宗教学的基本理论，较全面地了解世界各大宗教的历史与现状和中国的宗教法规与政策，接受独立思考、社会调研、分析问题等方面的基本训练。
2、亚非语言文学
亚非语言文学学科是国内最先开展亚非语言文学教学和研究的学科之一，涵盖的语种有越南语、印度尼西亚语、菲律宾语、泰国语、缅甸语、朝鲜（韩国）语、蒙古语、波斯语、希伯莱语以及西亚地区的多种古代语言（苏美尔语、阿卡德语、赫梯语、古希伯莱语等）。
其中有些语言专业是我国相关学科中历史最为悠久的。
3、电子商务
电子商务是2000年教育部批准设置的普通高等学校本科专业，属于电子商务类专业，基本修业年限为四年，授予管理学或经济学或工学学士学位，是以互联网等信息技术为依托、面向现代经济社会领域商务活动的新兴专业。
4、运筹学与控制论专业
运筹学与控制论是理学门类下一级学科数学下面的二级学科。它以数学和计算机为主要工具，从系统和信息处理的观点出发，研究解决社会、经济、金融、军事、生产管理、计划决策等各种系统的建模、分析、规划、设计、控制及优化问题。
5、农业生物环境与能源工程专业
农业生物环境与能源工程，是为了培养从事企事业、城乡、区域能源开发利用，设施农业工程及环境工程的设计、规划、运行管理和研究开发的高级工程技术人才。
以上内容参考 百度百科-宗教学专业
以上内容参考 百度百科-亚非语言文学
以上内容参考 百度百科-电子商务
以上内容参考 百度百科-运筹学与控制论专业
以上内容参考 百度百科-农业生物环境与能源工程专业