合肥的本科有：
1. 安徽大学
2. 中国科学技术大学
3. 合肥工业大学
4. 安徽医科大学
5. 安徽农业大学等。
解释：
安徽大学是合肥市的一所综合性重点大学，设有多个学院和研究中心，涵盖了文、理、工、管、法、医、教育、艺术等多个学科领域。
中国科学技术大学位于合肥，是一所以前沿科学和高新技术为主的研究型大学。其在物理、化学、材料科学等领域享有较高的国际声誉。
合肥工业大学是一所工科为主的大学，致力于培养工程技术人才。该校在多个工程学科领域具有较强实力，并与工业界有着紧密的联系。
安徽医科大学是安徽省的一所医学类高校，致力于医学教育、科研和医疗服务。该校在医学领域拥有雄厚的师资力量和先进的科研设施。
安徽农业大学是一所以农业为主的综合性大学，涵盖了农学、理学、工学、经济学、管理学等多个学科。该校在农业科技和生态环境保护等领域有着显著的研究成果。
以上仅是合肥的部分本科院校，实际上合肥市还有其他本科院校，这些学校共同为合肥市乃至安徽省培养了大量的专业人才，推动了地方的经济社会发展。