福建师范大学网络教育学院设有多个专业，其中包括法学、英语、计算机、教育管理、工商管理、思想政治、汉语言文学和数学与应用数学等。
法学专业旨在培养具备扎实法学理论基础，具备较强专业技能，能胜任司法工作，以及在国家机关、企事业单位和社会团体从事法律工作的高级专门人才。学生将学习德、智、体、美全面发展，以培养具有优秀职业素养的人才为目标。
英语专业致力于培养具备牢固英语语言基础和一定文学研究能力，具有广阔知识面和涉外领域相关知识及应用能力的英语专业人才。学生需要掌握英语听、说、读、写、译基本技能，具备英语语言学、英语对象国文化及相关人文和科技方面的基础知识。同时，学生还应具备运用现代教育技术进行英语教学的能力，以及一定的第二外国语实际运用能力。
计算机专业培养具有全面发展的本科学历的社会主义经济建设人才，要求学生具备良好的职业道德和专业技能，掌握计算机科学与技术应用的基本理论和技能。学生需了解专业领域最新成就和发展趋势，具有一定的科研创新能力。
教育管理专业旨在培养德、智、体、美全面发展的师资、行政管理人员和教育科研人员。学生将学习本专业的基础理论、基本知识和技能，了解相关学科的新成就和发展趋势。同时，学生需掌握党和国家的教育法规、方针政策，具备运用教育理论解决问题的能力。
工商管理专业培养具备经济学、管理学、法律知识和工商企业管理能力的本科学历人才。学生需掌握基本理论和技能，具备分析和解决经济管理问题的能力，掌握基本管理技能。毕业生能够在各类企事业单位、金融机构及政府部门从事管理、调研、咨询、研究和教学工作。
思想政治专业面向在职教师、教育行政管理人员以及党政机关、党校、干部学校、企事业单位等从事马克思主义理论教育和思想政治教育的专业人员。学生经过学习，将具备高等院校思想政治教育专业本科毕业水平，能够胜任相关教学、科研以及管理工作。
汉语言文学专业招收具有大学专科毕业程度的在职中小学教师、教育管理人员、文化、行政管理和其他专业人员。学生通过学习，将具备高等院校汉语言文学专业本科毕业水平，能够胜任中小学语文教学、教育管理、文化管理、新闻、宣传、编辑和相关工作。
数学与应用数学专业培养具有全面发展的本科学历的社会主义建设人才。学生需掌握数学教育的基本理论和技能，具备专业技能和实践能力。同时，学生还需了解本专业领域最新成就和发展趋势，具备一定的科研创新能力。
福建师范大学于2000年9月通过教育部专家组的实地考察与评估，2001年1月由国家教育部批准为重点支持建设网络教育学院，开展现代远程教育试点院校之一。可以面向东南亚地区开展汉语教学、向全国自主招生、自主设置专业、自主组织入学考试、自主确定招生地区和招生规模、并颁发国家承认的福建师范大学毕业证书和学位证书。现有远程教育在校生近万人。