四川大学华西口腔医院在学科建设方面实力雄厚，尤其在多个专业领域享有盛誉。
口腔内科作为四川省重点学科，由享有政府特殊津贴的知名专家教授坐镇，提供牙体、牙髓、牙周和口腔粘膜疾病治疗，如龋齿填充、根管治疗、牙周炎治疗，以及美齿服务，包括四环素牙、牙釉质不全和斑牙等。此外，还负责松牙固定、食物嵌塞和口腔溃疡的治疗。
口腔颌面外科作为国家重点学科，设有135张病床和4个病区，包括唇腭裂外科、创伤整形外科、头颈肿瘤外科和正颌及关节外科。专家们负责先天唇裂、腭裂等外科手术，以及颌面部外伤、肿瘤、整形美容、感染和神经疾患的治疗，如颞下颌关节疾患和牙槽外科手术。
口腔修复科，即镶牙科，作为国家重点学科，致力于牙齿缺失修复，采用CAD/CAM技术，涵盖部分或全部牙齿修复、假牙手术后修复等，如活动假牙、固定假牙和种植义牙。特色服务包括整铸支架义牙、烤瓷修复等。
口腔正畸科作为四川省重点，专长于青少年及成人牙颌畸形矫治，提供多种矫正技术，如方丝弓、直丝弓、Tip-Edge矫治，以及联合治疗和预防性工作。
儿童牙病科以儿童龋齿治疗、牙髓疾病和外伤应急处理为主，提供恒牙保护和乳牙间隙保持等服务。口腔预防工作侧重龋齿预防和牙周病防治。
特诊科专为高层领导及社会人士提供高级医疗保健，同时开展口腔临床治疗，电话预约服务5501451。颞颌关节病科专注于颞颌关节疾病的诊断和治疗，包括疼痛、弹响、张口受限等。
急诊科负责牙痛、牙龈疾病及面颈部外伤的快速处理。口腔中医科和针灸科则结合中西医治疗口腔和头颈颌面部疾病，如口腔粘膜炎症和神经性疾患。理疗科针对面瘫、疼痛、关节问题等多种疾病提供康复治疗。
四川大学华西口腔医学院/四川大学华西口腔医院前身为成都仁济牙科诊所，被誉为中国现代口腔医学的发源地和摇篮。四川大学华西口腔医院以“热忱·关爱”为服务理念，以“一切以病人为中心”为服务宗旨，实行教学、医疗、科研三位一体的管理模式。