高锰酸钾有很强的氧化作用，可氧化菌体的活性基团，对各种菌类都有良好的灭杀效果，对细菌繁殖体、真菌、结核杆菌等抑制作用，对肝炎病毒和芽孢也有灭活功效。
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口臭大多都是口腔和上消化到菌类感染所致，因此，用高锰酸钾溶液漱口能治疗口腔内菌类感染引起的口臭，对口腔发炎、龋齿等有治疗效果。
注意：高锰酸钾高浓度具有腐蚀性和刺激性，因此，漱口用的高锰酸钾浓度在0.002%即可，溶液颜色呈樱桃红色。
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高锰酸钾是坐浴的常用溶剂，对痔疮也十分有效，用0.1%的高锰酸钾溶液坐浴浸泡，可止痒止痛、防治感染，促进脱出的痔核复位，可复制治疗痔疮。
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高锰酸钾用清水兑成淡紫色，用以清洗外阴，对外阴部有感染、化脓病灶或手术切口都有杀菌治疗效果，可清洁外阴，预防感染。
注意：阴部黏膜比较脆弱，而高锰酸钾对皮肤有刺激作用，在清洗之后会比较干燥，因此，用高门酸钾清洗外阴浓度不可超过0.01%，以免损伤阴部皮肤。