北京生命科学研究所的领导集团由决策层的理事会构成，这个机构经过科技部的批准，其成员包括北京市政府和国家八个重要部委的代表。
理事会是研究所的核心决策机构，其最高职位是理事长，由北京市主管副市长苟仲文担任，他负责指导研究所的整体战略和决策。副理事长由理事会成员通过选举产生，目前的副理事长是闫傲霜，她担任北京市科学技术委员会主任的职务。
除两位主要领导人外，还有其他重要角色，如王宏广，他作为中国生物技术发展中心主任，同时也是北京生命科学研究所的理事，代表中华人民共和国科学技术部参与决策。同时，理事会还包括中华人民共和国国家发展和改革委员会、教育部、卫生部、中国科学院、国家自然科学基金委员会、中国医学科学院以及北京市人民政府等机构的代表，共同为研究所的发展贡献力量。
北京生命科学研究所，英文名称是“National Institute of Biological Sciences, Beijing（国家生命科学研究所，北京）”，位于北京市中关村生命科学园科学园路7号。