在公司组织形式上，有限责任公司和股份有限公司有共同点，也存在显著差异。首先，两者股东都对公司承担有限责任，即股东的责任以其投资额为限，公司的财产和股东个人财产是分离的，股东仅以其投资份额对公司债务负责，不受公司其他资产影响。
在责任承担方面，不论是有限责任公司还是股份有限公司，对外都以公司的全部资产为限承担责任。但有限责任公司成立条件相对宽松，仅限发起人集资，不公开募股，股东人数有上下限要求；而股份有限公司则成立条件严格，可公开募股，股东人数只有最低要求，无上限。
在股份转让方面，有限责任公司股东转让出资受到较多限制，相对困难，而在股份有限公司中，股权转让更为自由。股权证明形式也不同，有限责任公司以出资证明书形式存在，不可转让流通，股份有限公司的股权则是股票形式，可以转让和流通。
在公司治理结构上，有限责任公司由于股东人数有限，股东会权限较大，董事可能由股东兼任，所有权和经营权分离程度较低；而股份有限公司股东众多，股东会权限受限，董事会权限较大，所有权与经营权分离更为明显。
最后，财务公开程度差异明显。有限责任公司财务报表无需公开，仅需按规定送交股东；股份有限公司则需经注册会计师审计并公告，特别是募集设立的股份有限公司，其财务信息公开更为严格。
股份有限责任公司以自己的出资额为限对公司债务负责。同股份无限公司相比，有限公司的股东较少，许多国家公司法对有限公司的股东人数都有严格规定。如英、法等国规定，有限责任公司的股东人数应在2至50人之间，如果超过50人，必须向法院申请特许或转为股份有限公司。