1997年12月23日经中国人民银行批准设立。
1998年1月16日经中国人民银行浙江省分行核准，1998年3月23日湖州市人民政府决定，方大生同志为湖州市商业银行董事长兼行长，吴林元、刘明华两位同志为湖州市商业银行副行长。
1998年6月17日登记注册，取得浙江省工商行政管理局颁发的3300001001606号企业法人营业执照。
1998年11月18日，经中国人民银行湖州市分行批准，湖州市南浔镇城市信用合作社并入湖州市商业银行。
2001年5月11日，经中国人民银行湖州市中心支行批准，湖州市商业银行收购长兴县雉城城市信用社，并更名为湖州市商业银行长兴县支行。
2001年7月2日，经中国人民银行湖州市中心支行批准，湖州市商业银行收购德清县德清城市信用合作社，并更名为湖州市商业银行德清县支行。
2002年2月11日湖州市人民政府决定，于2002年2月21日湖州市商业银行股份有限公司首届十次董事会审议批准，2002年4月5日，经中国人民银行湖州市中心支行核准，方德明同志任湖州市商业银行副行长。
2003年2月25日，经湖州市人民政府决定，2003年3月4日，经湖州市商业银行股份有限公司首届十三次董事会审议批准，2003年7月7日，经中国人民银行湖州市中心支行核准，路国民同志任湖州市商业银行行长。
2003年7月14日，经中国人民银行湖州市中心支行批准（湖银复〔2003〕42号），湖州市商业银行开办借记卡业务。
2004年11月2日，经湖州银监分局批准，同意湖州市商业银行注册资本由10002万元增至30002万元。
2005年1月28日，2004年度临时股东大会审议批准，王天飞、应宜逊两位同志为湖州市商业银行独立董事。
2005年1月28日，湖州市商业银行第二届董事会第一次会议审议批准，2005年8月12日，经中国银行业监督管理委员会湖州监管分局核准，王三星同志为湖州市商业银行董事长。
2005年1月28日，湖州市商业银行第二届监事会第一次会议审议批准，2005年8月12日，经中国银行业监督管理委员会湖州监管分局核准，方大生同志为湖州市商业银行监事长。
2006年10月31日，经中国银行业监督管理委员会湖州监管分局批准，仙潭支行迁址并更名为湖州市商业银行安吉支行。
2007年，将2006年的分红3000万元转增为股本，每股认购价为人民币1元。至此，股本金增至33002万元。
2008年1月28日，经2008年度临时股东大会审议批准，周思选、虞群娥两位同志为湖州市商业银行独立董事。经湖州市商业银行第三届董事会第一次会议审议批准，路国民同志为湖州市商业银行董事长。聘请应建国同志为行长、经行长提名，方德明、方锋杰、高煜民、俞吉人同志为副行长。经湖州市商业银行第三届监事会第一次会议审议批准，杨德林同志为湖州市商业银行监事长。
