第1个回答 2009-04-09
400 持有疑惑的小兰
401 宝石抢匪现行犯(前篇)
402 宝石抢匪现行犯(后篇)
403 不可思议的天使之馆(前篇)
404 不可思议的天使之馆(后篇)
405 呼叫救护车的男子
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
409 同时进行的舞台和绑架(前篇)
410 同时进行的舞台和绑架(后篇)
411 神社鸟居之惊悚暗号(前篇)
412 神社鸟居之惊悚暗号(后篇)
413 完全一半犯罪之谜
414 追逐蓝色小鸟的少年侦探团
415 佛灭前出现的恶灵(事件篇)
416 佛灭前出现的恶灵(推理篇)
417 佛灭前出现的恶灵(解决篇)
418 米花町阁楼之家
419 八头蛇的剑(前篇)
420 八头蛇的剑(后篇)
421 银杏色的初恋(前篇)
422 银杏色的初恋(后篇)
423 侦探团和青虫四兄弟
424 来自小丑的图片邮件
425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间★
426 给兰的情书
427 超秘密的上学路(前篇)
428 超秘密的上学路(后篇)
429 无法归来的二人(前篇)
430 无法归来的二人(后篇)
431 本厅刑事恋爱物语7(前篇)
432 本厅刑事恋爱物语7(后篇)
433 柯南 奇怪的孩子
434 名犬Cool的功劳
435 聚焦侦探团的取材(前篇)
436 聚焦侦探团的取材(后篇)
437 上户彩和新一 4年前的约定
438 鱼邮件的追踪
439 然后谁都无须存在了
440 极限赛车表演
441通向死亡的“啊”
442 被钢筋阻止的男人
443 叹气拾潮(前篇)
444 叹气拾潮(后篇)
445 俄罗斯蓝猫的秘密
446 被封印的欧式窗(前篇)
447 被封印的欧式窗(后篇)
448 目黑的秋刀鱼事件
449 本厅刑事恋爱物语 虚假的婚礼★
450 手法VS魔术(前篇)
451 手法VS魔术(后篇)
452 金比罗剧院的怪人★
453 因缘和友情的试映会
454 颠倒的场景(前篇)
455 颠倒的场景(后篇)
456 我喜爱的推理小说
457 园子的红手帕(前篇)
458 园子的红手帕(后篇)
459 怪人 循规蹈矩的男人
460 一年B班大作战
461 消失的一页
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人(前篇)
467 坚不可摧的雪人(后篇)
468 池塘边的奇怪事件
469 怪盗KID与四幅名画(前篇)
470 怪盗KID与四幅名画(后篇)
471 失控的租赁车
472 工藤新一少年的冒险(前篇)
473 工藤新一少年的冒险(后篇)
474 妃英理律师之恋
475 厄运大奖
476 元太的必杀射门 (前篇)
477 元太的必杀射门 (后篇)
478 现实的30分钟
479 和服部平次在一起的3天★
480 黄色不在场证明
481 山妖姥姥的刀（前篇）
482 山妖姥姥的刀（后篇）
483 消失的巡警
484 黑色照片的去向（前篇）
485 黑色照片的去向（后篇）
486 从右向左的招财猫
487 本厅刑事恋爱物语8左手的无名指★
488 电视台的恶魔★
489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官★
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决★
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
第2个回答 2009-04-09
400 持有疑惑的小兰
401 宝石抢匪现行犯(前篇)
402 宝石抢匪现行犯(后篇)
403 不可思议的天使之馆(前篇)
404 不可思议的天使之馆(后篇)
405 呼叫救护车的男子
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
409 同时进行的舞台和绑架(前篇)
410 同时进行的舞台和绑架(后篇)
411 神社鸟居之惊悚暗号(前篇)
412 神社鸟居之惊悚暗号(后篇)
413 完全一半犯罪之谜
414 追逐兰色小鸟的少年侦探团
415 佛灭前出现的恶灵（事件篇）
416 佛灭前出现的恶灵（推理篇）
417 佛灭前出现的恶灵（解决篇）
418 米花町阁楼之家
419 八头蛇的剑(前篇)
420 八头蛇的剑(后篇)
421 银杏色的初恋(前篇)
422 银杏色的初恋(后篇)
423 侦探团和青虫四兄弟
424 来自小丑的图片邮件
2006年
*425 Black impact ! 被组织的魔掌触碰的瞬间
426 给兰的情书
427 超秘密的上学路(前篇)
428 超秘密的上学路(后篇)
429 无法归来的二人(前篇)
430 无法归来的二人(后篇)
431 本厅刑事恋物语7(前篇)
432 本厅刑事恋物语7(后篇)
433 柯南 奇怪的孩子
434 名犬cool的功劳
435 聚焦侦探团的取材（前篇）
436 聚焦侦探团的取材（后篇）
437上户彩和新一 4年前的约定
438 鱼邮件的追踪
439 然后 谁都不在了
440 极限飞车
441 临终的啊啊
442 被钢铁构架阻挡的男子
443 叹气赶海（前篇）
444 叹气赶海（后篇）
445 俄罗斯蓝猫的秘密
446 封印的欧式窗（前篇）
447 封印的欧式窗（后篇）
448 目黑的秋刀鱼事件
*449 本厅刑事恋爱物语8 伪装的婚礼
450 圈套 VS 魔术(前篇)
451 圈套 VS 魔术(后篇)
*452 金比罗座的怪人
453 因缘和友情的试映会
454 颠倒的场景（前篇）
455 颠倒的场景（后篇）
456 我喜欢的推理
457 园子的红手帕（前篇）
458 园子的红手帕（后篇）
2007年
460 一年B班大作战
461 消失的1页
462 黑衣组织的魅影 年幼的目击者
463 黑衣组织的魅影 奇妙的照明
464 黑衣组织的魅影 谜一样的高额报酬
465 黑衣组织的魅影 珍珠般的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）/2007.03.05
468 池边的怪事件/2007.03.12
469 怪盗基德和四名画（前篇）/2007.04/16
470 怪盗基德和四名画（后篇）/2007.04/23
471 失控的租赁车/2007.05.07
472 新一少年时的冒险（前篇）
473 新一少年时的冒险（后篇）
474 妃英理律师之恋
475 恶运大奖
476 元太的必杀曲线球（前篇）
477 元太的必杀曲线球（后篇）
478 即时30分钟
*479 和服部平次一起的3天
480 黄色不在场证明
481 鬼婆婆的刀（前篇）
482 鬼婆婆的刀（后篇）
483 消失的巡警
484 黑色照片的去向（前篇）
485 黑色照片的去向（后篇）
486 从右向左 招财猫
*487 本厅刑警的恋爱故事 左手无名指
*488 电视台的恶魔
*489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官
*490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决
2008年
491 红与黑的碰撞 开始
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱 3/3
499 红与黑的碰撞 伪装 3/10
500 红与黑的碰撞 遗言 3/17
第3个回答 2009-04-12
400 持有疑惑的小兰
401 宝石抢匪现行犯(前篇)
402 宝石抢匪现行犯(后篇)
403 不可思议的天使之馆(前篇)
404 不可思议的天使之馆(后篇)
405 呼叫救护车的男子
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
409 同时进行的舞台和绑架(前篇)
410 同时进行的舞台和绑架(后篇)
411 神社鸟居之惊悚暗号(前篇)
412 神社鸟居之惊悚暗号(后篇)
413 完全一半犯罪之谜
414 追逐兰色小鸟的少年侦探团
415 佛灭前出现的恶灵（事件篇）
416 佛灭前出现的恶灵（推理篇）
417 佛灭前出现的恶灵（解决篇）
418 米花町阁楼之家
419 八头蛇的剑(前篇)
420 八头蛇的剑(后篇)
421 银杏色的初恋(前篇)
422 银杏色的初恋(后篇)
423 侦探团和青虫四兄弟
424 来自小丑的图片邮件
425 Black impact ! 被组织的魔掌触碰的瞬间
426 给兰的情书
427 超秘密的上学路(前篇)
428 超秘密的上学路(后篇)
429 无法归来的二人(前篇)
430 无法归来的二人(后篇)
431 本厅刑事恋物语7(前篇)
432 本厅刑事恋物语7(后篇)
433 柯南 奇怪的孩子
434 名犬cool的功劳
435 聚焦侦探团的取材（前篇）
436 聚焦侦探团的取材（后篇）
437上户彩和新一 4年前的约定
438 鱼邮件的追踪
439 然后 谁都不在了
440 极限飞车
441 临终的啊啊
442 被钢铁构架阻挡的男子
443 叹气赶海（前篇）
444 叹气赶海（后篇）
445 俄罗斯蓝猫的秘密
446 封印的欧式窗（前篇）
447 封印的欧式窗（后篇）
448 目黑的秋刀鱼事件
449 本厅刑事恋爱物语8 伪装的婚礼
450 圈套 VS 魔术(前篇)
451 圈套 VS 魔术(后篇)
452 金比罗座的怪人
453 因缘和友情的试映会
454 颠倒的场景（前篇）
455 颠倒的场景（后篇）
456 我喜欢的推理
457 园子的红手帕（前篇）
458 园子的红手帕（后篇）
2007年
460 一年B班大作战
461 消失的1页
462 黑衣组织的魅影 年幼的目击者
463 黑衣组织的魅影 奇妙的照明
464 黑衣组织的魅影 谜一样的高额报酬
465 黑衣组织的魅影 珍珠般的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）/2007.03.05
468 池边的怪事件/2007.03.12
469 怪盗基德和四名画（前篇）/2007.04/16
470 怪盗基德和四名画（后篇）/2007.04/23
471 失控的租赁车/2007.05.07
472 新一少年时的冒险（前篇）
473 新一少年时的冒险（后篇）
474 妃英理律师之恋
475 恶运大奖
476 元太的必杀曲线球（前篇）
477 元太的必杀曲线球（后篇）
478 即时30分钟
479 和服部平次一起的3天
480 黄色不在场证明
481 鬼婆婆的刀（前篇）
482 鬼婆婆的刀（后篇）
483 消失的巡警
484 黑色照片的去向（前篇）
485 黑色照片的去向（后篇）
486 从右向左 招财猫
487 本厅刑警的恋爱故事 左手无名指
488 电视台的恶魔
489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决
491 红与黑的碰撞 开始
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
有希子和优作首次登场在043 江户川被拐事件
第4个回答 2009-04-08
我来回答一下第二个问题好了。
黑衣人的真正的首脑，就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。LEE。
事情是这样的，工藤优作原先就 怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的 同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本 ，所以你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的，而成功后哀的父母意外身亡。阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没有其他的副作用。但是突然有一天，优作和有纪子突然潜回日本，和柯南（103-104集）秘密接触，让他感受到了威胁，于是安排一个间谍时刻跟随在柯南的身边，那就是灰原哀。哀其实是APTX-4689的第一个实验品，本来药的目的是永葆青春，没想到竟然适得其反产生副作用，造成了身体变小。而柯南事件发生后，哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。为什么柯南从来没有被骚扰过就是因 为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下。毛利小五郎也是因为追查阿笠才从警界退出的，当时枪击非英里事件只是借口，所以后来暮木说毛利总是把他们引向歧途。
青山老师已经给大家提示了，不过因为太晦涩所以没几个人看得出来。其实阿笠这两个字，如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写就是拉丁 文里面的莫里亚帝。所以阿笠博士其实应该叫莫里亚帝教授——福尔摩斯里的罪恶的教授。