1. 职能股（室）
- 办公室（含财会，信息中心）：负责日常工作协调，文件起草，会议组织，档案、信息管理等工作。负责财务监督，编制预算，管理国有资产，监督下属单位财务活动。
- 人事教育股（与直属机关党委办公室合署）：负责人事编制、教育培训、领导班子管理、出国政审等工作，同时负责监察、纪检和行风建设。
- 督察队：检查执行上级决定，纠正违纪违规行为，受理投诉，指导行政督察工作，制定相关制度，处理申诉。
- 法规股：负责行政复议、诉讼案件应诉，法制宣传和执法监督工作。
- 经济检查股（打击传销办公室）：监管市场交易行为，查处不正当竞争、走私贩私等行为。
- 登记注册股：负责内资企业注册登记，指导企业登记工作，协调相关职能。
- 企业监督管理股：负责企业经营行为监管，查处无照经营，组织年检和验照工作。
- 市场合同管理股：监督市场管理，指导专项治理，组织市场注册，调解合同争议，监管拍卖。
- 商标广告管理股：管理商标使用和广告经营，查处商标侵权和违法广告。
2. 直属行政单位
- 经济检查大队：负责经济违法案件的查处，拟定规章制度和措施。
3. 事业单位
- 机关服务中心：负责机关事务协调，接待、安全保卫、物业管理等工作。
- 消费者权益保护委员会（12315投诉举报中心）：受理消费者投诉，提供咨询服务，保护消费者权益。
4. 社团与协会
- 个体劳动者协会和私营企业协会：开展学习教育，维护合法权益，提供法律咨询和服务，协助政府管理。
5. 派出机构工商所：受区、县工商局指导，负责企业登记、市场监督、合同管理等工商行政管理工作。