2010年9月25日，由段树民院士（浙江大学）担任组长，王晓民（首都医科大学）、罗跃嘉（北京师范大学）、陈军（第四军医大学）、顾晓松（南通大学）教授，以及教育部领导池颖等人组成的教育部评估专家团队莅临我校，对“基因工程教育部重点实验室”进行了现场评估。评估当天，评估学术报告会在生命科学学院贺丹青堂会议室召开，副校长许宁生院士亲临现场，对专家们的到来表示热烈欢迎和深深感谢，并诚恳请求他们为实验室的建设提出宝贵意见。科技处董美玲副处长、生命科学学院党委书记武少新、常务副院长束文圣教授和副院长冯双副教授等也参加了此次报告会。
实验室主任屈良鹄教授向专家们做了详尽的“基因工程教育部重点实验室工作报告”，概述了实验室自2005年以来的发展历程，包括目标设定、研究方向、科研团队成就、人才培养和管理机制等。邵鹏博士、陈月琴等代表团队展示了代表性研究成果。评估专家们通过听取报告、实地考察实验室、访谈教师及查阅相关资料，对实验室进行了全面评估。他们认为，实验室自2000年成立以来，始终聚焦华南乃至全国重大需求，紧跟国际科研前沿，尤其在基因资源、农作物育种、疾病基因调控和药物基因工程等领域取得了显著进展。实验室还建立了RNA组学、植物基因工程和医药基因工程研究平台，人才队伍建设和学术交流方面也取得了显著成果。
在科研项目和经费方面，实验室已承担了155项国家、省部级项目，包括“973”、“863”等重大科研项目，以及多项国家级基金项目，累计科研经费达7239万元。实验室成果显著，部分研究成果达到国际先进水平，非编码RNA的研究更是处于国际领先位置，曾获得多项国家级奖项，如国家自然科学奖二等奖和广东省科学技术奖一等奖等。
副校长徐安龙在专家反馈意见会议上表示了对专家们辛勤工作的感谢，并表示学校将积极支持实验室的进一步发展，助力实验室实现更大的突破。