嗨！
建议你使用线刷重新刷一次完整包（稳定版，开发版你根据自己的使用选择），尝试可否正常：
先用小米手机的备份工具来备份的，打开桌面上的系统与安全～备份～新建备份，然后进入recovery模式三清数据。
备份是把手机里面的资料打包备份在内存卡（米2和米3系列是内存设备）里面的，三清数据，只会清除手机内部存储里面的资料，不会清空内存设备上面的。
1，线刷的方法步骤- 小米手机官方论坛
http://bbs.xiaomi.cn/thread-4274791-1-1.html
2，小米手机所有的刷机包下载的链接：http://www.miui.com/thread-790375-1-1.html
3，线刷过程问题的解决之一——驱动 - 小米手机官方论坛
http://bbs.xiaomi.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=8560591&pid=159362934&page=8&extra=#comment_top
4，【线刷过程问题的解决之二——刷机过程详解 - 小米手机官方论坛
http://bbs.xiaomi.cn/thread-8560920-1-1.html