湖北工业大学继续教育学院的组织机构包含多个部门，各司其职，为学生和学员提供全方位的服务。首先，院办公室承担着重要的行政职责，负责工作接待、联络咨询、信访接待，以及文件处理、印鉴管理等日常管理工作，同时提供接待服务中心的运营管理。
招生与就业指导办公室专注于成人教育，负责与成教教学站的联络，新生报名、宣传、咨询，包括成人报考、录取事宜，以及就业推荐和就业咨询服务，助力学生的职业发展。
自学考试办公室主要负责自考招生计划的制定，自考与函授考试的报考、转考、免考申请，成绩查询和证书档案的管理，同时为学生开具相关证明文件。
培训部则专注于非学历教育，管理基地和师训中心工作，提供全国计算机等级考试的报考咨询，组织各类培训活动，包括报名、宣传、考试和证书办理，还负责机房的日常管理。
教学工作办公室负责继续教育的教学管理，包括课表安排、教室借用、补考清考安排，成绩查询，以及高职学生学籍管理、成人学士学位申报和教材管理工作。
学生工作办公室关注学生事务，包括成教生的学籍管理、宿舍安排和管理，以及相关证件的办理，如转学、学生证和乘车证，同时处理毕业证书发放和档案管理，开具学生证明。
最后，学生档案室负责保管学生的个人档案资料，确保信息的安全和完整。而马房山校区总务科则负责学生宿舍的日常管理和校区的后勤保障，确保教学区的正常运行。