日本大学世界排名前100有东京大学、京都大学、东京工业大学、大阪大学、东北大学等。
一、东京大学
1、诞生于1877年，由“东京开成学校”与“东京医学校”在明治维新期间合并改制而成，初设法学、理学、文学、医学四个学部和一所大学预备学校，是日本第一所国立综合性大学。
2、其部分科系最早可以溯源到灵元天皇时期；学校于1886年更名为“帝国大学”，这也是日本建立的第一所帝国大学；1897年，其易名为“东京帝国大学”；二战后的1947年9月，正式定名为“东京大学”。
二、京都大学
1、京都大学起源于1861年。二战后，正式更名为“京都大学”。不同于日本其他大学，京都大学推崇自由与自主的科研学习氛围，主张学生在“自重、自敬”的基础上个性化发展。校内实行学生自治，“有志者致学，无志者尽兴”的学术氛围是京都大学的特点之一。
2、京都大学拥有京都大学iPS细胞研究所、京都大学数理解析研究所、京都大学防灾研究所等多个科研机构。
三、东京工业大学
1、东京工业大学的前身是1881年以培养工学方面专业人才为目的而建立的“东京职工学校”。1929年，其被提升为国立大学。
2、截至2018年1月，东京工业大学共有6个学院，以及科学技术创成研究院、未来产业技术研究所等150余个校内共同教育研究设施。在校本科生4803人，硕士与博士生共计5159人。常任教职员1708人，非常任教职员1839人。师生人数比为1:6。
四、大阪大学
1、大阪大学起源于1838年绪方洪庵设立的兰学塾“适塾“。1931年，原大阪医科大学的医学部与理学部组成大阪帝国大学，成为日本第六所旧帝国大学，之后吸收了原大阪工业大学的工学部。
2、二战后，正式更名为大阪大学，并陆续统合了大阪高等学校、浪速高等学校、大阪药学专门学校，形成一所规模较大的综合性大学。2007年，与大阪外国语大学合并，为其外国语学部。
五、东北大学
1、东北大学的前身是旧帝国大学之一的东北帝国大学（1907年成立，原名仙台医科大学）。该校起源于1736年的仙台藩藩校“明伦养贤堂”，东北帝国大学是继东京帝国大学、京都帝国大学之后的第3所旧制帝国大学。
2、1947年10月，东北帝国大学改制为东北大学，成为日本第一所接收女学生和外国学生的大学。2007年，学校举行了100周年校庆。