马祖地区拥有丰富的文化教育资源，其中主要的教育机构包括：
在高中阶段，马祖高级中学是一所知名的学府，致力于提供高质量的教育。这所学校为学生提供了良好的学习环境和丰富的课程，帮助他们为未来的发展打下坚实基础。
对于基础教育，连江县内设有多所国民中学，如连江县立中山国民中学、中正国民中学、介寿国民中学、东引国民中学和敬恒国民中学。这些学校都是连江县教育体系的重要组成部分，注重培养学生的综合素质和公民意识。
在小学阶段，连江县同样有多所国民小学，如中正国民小学、介寿国民小学、仁爱国民小学、东引国民小学、东莒国民小学、坂里国民小学以及敬恒国民小学和塘岐国民小学。这些小学注重启蒙教育，为孩子们提供了良好的学习起步点。
这些学校不仅提供了教育资源，也是传承和发扬马祖文化的重要场所，为当地社区输送了大批有知识、有技能的人才。
马祖，即福建省福州市连江县马祖乡，位于福建省闽江口，台湾海峡正北方，实际由台湾当局控制，设“连江县”，实际管辖面积29.6平方公里，辖4乡，政治中心位于南竿乡（马祖岛），一般通称“马祖地区”，简称马祖。马祖地区由马祖岛（又称南竿岛）、北竿岛、东莒岛（东犬岛）、西莒岛（西犬岛）、东引岛、西引岛及其附属岛屿共36个岛礁组成，地理名词又合称为马祖列岛，现为台湾地区“马祖国家风景区”。另有唐代人名马祖（709—788）俗姓马，名道一，世称“马祖道一”，因在江西弘扬禅学，又称“江西马祖”。唐代汉州什邡（今四川）人。