首先，二十八将并没有进行严格意义上的排名。
汉明帝追思光武帝刘秀，就把和刘秀一起打天下的二十八个功劳特别大的将军画像放在南宫云台。并没有做什么排名。
明面上没有排名，但是记载的时候总得有个先来后到吧，所以就有了云台二十八将的排名。
要论战功，排名前十位的都差不多，刘秀平天下打了那么多仗，每位将军都有自己不可磨灭的贡献。要论名望，恐怕没人能超过冯异和马援。但是伏波将军马援因为和汉明帝有亲，所以避嫌没入云台二十八将之列。大树将军冯异是一个你可以绝对放心把后背交给他的人，邓禹经略关中无果，还是冯异替他收的场，但是因为冯异早逝，也只排第七位。
那为什么邓禹能被安排到第一位呢？
首先，邓禹和刘秀关系不一般，刘秀早在京师学习时就和邓禹相识，并且关系莫逆。刘玄继位后，多少人都推荐邓禹去刘玄那当官，但是邓禹死活就是不去。一听说刘秀在河北打拼，马上就去投奔刘秀了。一来邓禹这人有眼光，知道刘玄不成事。二来当年的友谊邓禹也是没有忘记的。
其次，邓禹在刘秀事业刚起步时投奔刘秀，可以算得上是元老级人物了。虽然当时刘秀身边早就有以吴汉，耿弇为首的上谷，渔阳突骑。但是上谷，渔阳两地突骑并不能算是刘秀的嫡系军队，他们是吴汉，耿弇从北地带出来的，他们听从的是吴汉等人的命令，因为吴汉等人听刘秀，他们才可以被刘秀驱使。刘秀虽然手握精锐，实则是孤家寡人。但是邓禹到来后，很快就给刘秀招募了数千人的嫡系队伍，这帮人才是刘秀的底气。
其三，邓禹在在相当长的时间里，担任的一直是刘秀的智囊， 他给刘秀提了几条很宝贵的建议，非常具有战略眼光，可以说是刘秀的指路明灯了，其重要性，不亚于高祖之张良，昭烈之诸葛。后来刘秀放邓禹自领一军去经略关中，虽然邓禹给搞砸了，但是这并没有影响邓禹在刘秀心目中的位置。
其四，邓禹不光和刘秀关系好，他和刘秀儿子的关系也不一般。刘庄继位后，那么多元勋，为什么偏偏让邓禹当太傅，对邓禹还非常尊敬，邓禹病重时几次去照看。要知道云台二十八将可是刘庄搞的。他对邓禹这种态度，不得不让人在排名时好好考虑一下。
最后，官职问题，云台二十八将座次虽然不是严格按照官职大小排的，但是绝对受其影响，邓禹当时官拜太傅，虽然是虚衔。但是可是实打实的正一品官，其地位之高，无人能出其右。