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photoshop美化进化树
关于生物信息学的建
进化树
问题
答:
你可以把建好的
进化树
弄到
Photoshop
里改这些序列名或登录号。
iqtree建立系统发育树——ML法
答:
建树完成后,你会在文件夹中看到一系列成果,如运行日志、一致树和ML树文件。这时,使用如Figtree这样的可视化工具来查看和分析,甚至可以借助Adobe
Photoshop
进行精细的编辑和
美化
,让你的研究成果更具说服力。系统发育树的构建并非一蹴而就,而是需要精心的准备和精确的操作。IQtree的ML法提供了一个强大...
分子
进化
笔记(四): MEGA5构建系统发育树
答:
方法2:点击Image,选择Copyto Clipboard。粘贴到Word中,右击进化树图片,编辑图片。即可更改字体字号
。修改好可以了。或者进一步导出图片格式:先将该word文件打印生成PDF文件,再用Adobe Illustrator CS6或Adobe Photoshop CS6导出图片格式。
进化树
构建需要哪些工具
答:
或者使用Tree-puzzle,速度也较快,并且该程序做蛋白质序列的
进化树
效果比较好。而PAML则并不适合构建进化树。ML的模型选择是看构出的树的likelihood值,从参数少,简单的模型试起,到likelihood值最大为止。ML也可以使用 PAUP或者PHYLIP来构建。这里作者推荐的工具是BioEdit。BioEdit集成了一些PHYLIP的程序,用来构建进化树。
建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值
答:
三、构建
进化树
1.N-J法建树依次应用PHYLIP软件中的SEQBOOT.EXE、DNADIST.EXE、NEIGHBOR.EXE和CONSENSE.EXE打开。具体步骤如下:(1)打开seqboot.exe输入文件名:输入你用CLASTAL X生成的PHY文件(*.phy)。R为bootstrap的次数,一般为1000 (设你输入的值为M,即下两步DNADIST.EXE、NEIGHBOR.EXE中...
如何用mega进行核酸一致性分析
答:
而MEGA和PHYLIP也可以用来构建
进化树
。考虑到有些帖子的内容与分子进化无关。对于各种模型之间的理论上的区别,000~4,等等,请问与上个树比,则结果较为可靠,有时严重干扰进化树的构建,是关于分子进化的。粗略地归纳一下,一般用两种不同的方法构建进化树,而
Photoshop
,NJ往往出现Long-branch ...
tree-puzzle
答:
一般的
进化树
分析中较少应用。由于该方法需要很多背景的知识,这里不作介绍。表1 构建分子进化树相关的软件软件 网址 说明ClustalX 图形化的多序列比对工具ClustalW 命令行格式的多序列比对工具GeneDoc 多序列比对结果的
美化
工具(可以导入fasta格式的文件,出来的图可用于发表,我用过)BioEdit 序列分析的综合工具MEGA 图形...
phyml软件怎么使用
答:
一般的
进化树
分析中较少应用。由于该方法需要很多背景的知识,这里不作介绍。表1 构建分子进化树相关的软件软件 网址 说明ClustalX 图形化的多序列比对工具ClustalW 命令行格式的多序列比对工具GeneDoc 多序列比对结果的
美化
工具(可以导入fasta格式的文件,出来的图可用于发表,我用过)BioEdit 序列分析的综合工具MEGA 图形...
megalign怎么构建
进化树
答:
例如,“想在基因组水平比较两个或三个比较接近物种之间的进化年代的远近,具体推算出他们之间的分歧时间”,“如何估计病毒进化中变异所需时间”,等等。7.
进化树
的编辑 例如生成的进化树图片,如何进行后续的编辑,比如希望在图片上标注某些特定的内容,等等。由于相关的帖子太多,作者在这里对无法阅读...
怎样找到菌的相似序列,怎样做细菌系统发育树?
答:
2.关于构建
进化树
的方法的选择例如,“用boostrap NJ得到XX图,请问该怎样理解?能否应用于文章?用boostrap test中的ME法得到的是XXX树,请问与上个树比,哪个更好”,等等。3.关于软件的选择例如,“想做一个进化树,不知道什么软件能更好的使用且可以说明问题,并且有没有说明如何做”,“拿到了16sr RNA数据,打算做...
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