1、认股权证和股份期权不同
非同一控制下的企业合并等的行权价格低于当期普通股平均市场价格时，应当考虑其稀释性。 计算统账结合，作为分子的净利润金额不变；
而同一控制下的企业合并的调整项目为按照本准则第十条中规定的公式所计算的增加的普通股股数，同时还应考虑时间权数。 当期发行认股权证或股份期权的，普通股平均市场价格应当自认股权证或股份期权的发行日起计算。
2、可转换公司债券不同
对于非同一控制下的企业合并，计算稀释每股收益时，分子的调整项目为可转换公司债券当期已确认为费用的利息等的税后影响额；
而同一控制下的企业合并的调整项目为假定可转换公司债券当期期初或发行日转换为普通股的股数加权平均数。
3、范围不同
非同一控制下的企业合并资产包括净利润扣除了非经常损益后得到的每股收益。
而同一控制下的企业合并资产包括那些一次性的资产转让或者股权转让带来的非经营性利润。
参考资料来源：百度百科-非同一控制下企业合并
同一控制下的企业合并和非同一控制下的企业合并在编制财务报表的区别如下：
1、概念不同
同一控制下的企业合并财务报表是基本会计作账表格，是各科目结余情况.把这表的余额填在资产负债表上和损益表上,就出了报表。
而非同一控制下的企业合并财务报表在资产负债表里反映的是至本月末各资产负债的金额.在各明细分类帐中反应的是各明细帐户至本月末的最新金额。我们所申报的资产负债表是根据总分类帐各科目余额的最新数据申报。
2、制作方法不同
同一控制下的企业合并财务报表制作所有已制单的单据的余额，原理为期初余额+（或-）本期发生额（包括借方发生额和贷方发生额）=期末余额；只是在选项时有无包括已记帐凭证，就是范围，一般应选择包括未记帐的凭证。
而非同一控制下的企业合并财务报表需要各个科目的余额，一般包括上期余额,本期发生额,期末余额等。
通俗点说就是跟据汇总的凭证而形成的每个科目的余额，而这些科目分属于资产、负债和所有者权益，所形成的等式就是资产=负债+所有者权益。
3、作用不同
同一控制下的企业合并财务报表作用就是用于查询公司的会计科目的发生额、余额等会计信息。
而非同一控制下的企业合并财务报表主要是为了方便做财务报表。
4、制作的时间不同
同一控制下的企业合并财务报表在年末制作，而非同一控制下的企业合并财务报表在年初制作。
参考资料来源：百度百科-同一控制下的企业合并
百度百科-非同一控制下的企业合并本回答被网友采纳1、认股权证和股份期权不同
非同一控制下的企业合并等的行权价格低于当期普通股平均市场价格时，应当考虑其稀释性。 计算统账结合，作为分子的净利润金额不变；
而同一控制下的企业合并的调整项目为按照本准则第十条中规定的公式所计算的增加的普通股股数，同时还应考虑时间权数。 当期发行认股权证或股份期权的，普通股平均市场价格应当自认股权证或股份期权的发行日起计算。
2、可转换公司债券不同
对于非同一控制下的企业合并，计算稀释每股收益时，分子的调整项目为可转换公司债券当期已确认为费用的利息等的税后影响额；
而同一控制下的企业合并的调整项目为假定可转换公司债券当期期初或发行日转换为普通股的股数加权平均数。
3、范围不同
非同一控制下的企业合并资产包括净利润扣除了非经常损益后得到的每股收益。
而同一控制下的企业合并资产包括那些一次性的资产转让或者股权转让带来的非经营性利润。
参考资料来源：百度百科-非同一控制下企业合并