地下水功能的综合评价指数是指表征地下水可持续性、功能或相关属性状况的指标，是对支撑其所有考核指标耦合的量化评判结果，即下列公式中的R值。
区域地下水功能可持续性评价理论与方法研究
式中：R为综合评价指数；ai为考核指标的权重；Xi为考核指标，等于di/dmax或di/d极值；n为考核指标的个数。
地下水优势功能是指地下水功能区划的各分区内最强的地下水某一功能，或是资源功能、或是生态功能、或是地质环境功能，它源于支撑其能力的相应属性耦合。
地下水脆弱功能是指地下水功能区划的各分区内最弱的地下水某一功能，或是资源功能、或是生态功能、或是地质环境功能，它源于支撑其能力的相应属性耦合。
地下水主导功能评价是指将所有地下水功能作为研究目标（对象）评价基础上确定优先利用或保护地下水功能的方法，它综合反映流域尺度地下水循环系统各区带优势功能和脆弱功能的区位特征。
地下水目标功能评价是指根据项目要求选择地下水系统中某一功能作为研究目标（对象）进行评价，以期进一步了解该地下水功能分布的区位特征，它系统地表征某一功能在流域尺度地下水循环系统内各区带区位特征和状态。