1945年以前在五九七农场长林岛地区有抗日联军活动。1947年8月双鸭山农场的前身集贤县公营农场在四方台地区开荒建点。1947年12月正式命名，归集贤县人民政府生产部领导。1948年8月，曙光农场的前身桦南农场建立。1954年12月友谊农场建立。1955年，二九一农场建立，该场原为农建二师第六团。
1956年6月1日八五二农场建立，该场人员以原铁道兵、三师复转官兵为主体，初时以铁道兵番号“八五”为头，以大队“0 二”编号区“0”为尾，命名为八五二农场，归铁道兵农垦局管理。同年10月八五三农场建立，该场是以铁道兵六师、十一师转业官兵为主建立的，初时以铁道兵部队代号定名为八五0三分场，11月经农垦部批准改称为八五三农场，隶属于铁道兵农垦局。
1960年铁道兵农垦局改为牡丹江农垦局，八五二、八五三两场仍归其领导。
1957年铁道兵农垦局将八五二农场三分场扩建为八五五农场，1957年9月改为五九七农场。1957年集贤、曙光、友谊、二九一农场划归合江农垦局。牡丹江农垦局、合江农垦局均由中央农垦部领导。
1963年，牡丹江农垦局与合江农垦局合并，建立东北农垦总局（简称“东总”，直属中央农垦部），原两局所属的各农场统归东北农垦局总局管辖。1963年1月由省农管厅所属的金沙农场中分出而独立建场的北兴农场亦归属“东总”。1964年，江川农场的前身万宝农场建立。该场是由原佳木斯市所属的万里河农场和宝山农场合并而成。饶河农场从八五九农场分出。1965年万宝、饶河两场皆归属东北农垦总局。 由于政治形式的变化，农垦系统的机构也发生了变化。根据毛泽东1968年6月18日的批示（称“六.一八”批示），撤消东北农垦总局，组建了沈阳军区黑龙江生产建设兵团。
1968年9月25日兵团三师组建，并开始对所属十七个国营农场改组，编成十四个团，两个独立营。
根据中央“压缩部队定额，调整编制体制”的指示精神，1976年2月撤消了黑龙江生产建设兵团，成立黑龙江省农垦总局，下设国营农场管理局，原兵团三师改为红兴隆国营农场管理局，三师所属各团恢复农场。为了加快垦区社会主义市场经济体制改革进程，进一步推进垦区管理体制改革，由行政管理型向企业管理型转变，根据省委、省政府、农业部的指示精神和总局《关于黑龙江省农垦总局管理体制改革方案》的规定要求，1996年3月27日将管理局改为总局（总公司）的派出机构，名称为“黑龙江农垦（集团）总公司红兴隆分公司、黑龙江省农垦局红兴隆分局”，设立党委名称为“中共黑龙江省农垦总局红兴隆分局委员会”。
