1、缴纳对象不同，自由职业医疗保险缴纳对象为有收入的人员。而城镇基本医疗保险缴纳对象为：未满18周岁的人员，18周岁以上仍在全日制学校就读人员，18周岁以上城镇非从业居民，低保对象。
2、缴纳费用不同，自由职业医疗保险缴纳金额每年需要三到五千甚至更高不等，具体由当地社保局决定。而城镇居民基本医疗保险缴纳金额一般每年几百元。
3、报销比例不同，自由职业医疗保险报销比例高。而城镇居民基本医疗保险保险比例低。
4、缴纳时间不同，自由职业医疗保险可以每月缴纳，也可以选择年交一次。而城镇居民基本医疗保险则一年只交一次。
扩展资料
城镇居民基本医疗保险报销范围
（一）住院治疗的医疗费用；
（二）急诊留观并转入住院治疗前7日内的医疗费用；
（三）符合城镇居民门诊特殊病种规定的医疗费用；
（四）符合规定的其他费用。
自由职业医疗保险报销范围
基本医疗保险支付部分费用的诊疗项目范围
（一）诊疗设备及医用材料类
1、应用X—射线计算机体层摄影装置(CT)，立体定向放射装置(γ—刀、χ—刀)、心脏及血管造影X线机(含数字减影设备)、核磁共振成像装置(MEI)、单光子发射电子计算机扫描装置(SPECT)、彩色多普勒仪、医疗直线加速器等大型医疗设备进行的检查、治疗项目;
2、体外震波碎石与高压氧治疗
3、心脏起搏器、人工关节、人工晶体、血管支架体内置换的人工器官、体内置放材料
4、省物价部门规定的可单独收费的一次性医用材料。
（二）治疗项目类
1、血液透析、腹膜透析
2、肾脏、心脏瓣膜、角膜、皮肤、血管、骨、骨髓移植
3、心脏激光打孔、抗肿瘤细胞免疫疗法和快中子治疗项目。
（三）单次费用在400元以上的医疗仪器与设备的检查、治疗项目和医用材料。
参考资料来源：