正常版本只能捉到以下神兽
3神鸟LV50：急冻鸟、闪电鸟、火焰鸟（地点和GB版一致）；
三圣兽LV50：雷皇（杰尼龟)炎帝(妙蛙种子）水君（小火龙）与初始选择的PM有关，打败4天王后会在关东地图随机遇到。
超梦LV70：完成红蓝宝石任务后再花田洞穴内深处遇到。
要提高神兽捕捉率，需要做到以下两点：精灵的状态（烧毒麻修正1.5，睡眠冰冻修正3），精灵球（时间球30回合以上修正4）。依据以下公式：捕捉率＝（最大HP×3－当前HP×2)÷（最大HP×3）×精灵捕获率×精灵球修正×精灵状态÷255。用会刀背打的精灵将它打成1HP然后催眠30回合以上用时间球很容易捕捉到。如果是其他版，如下NO.377雷兽:在岛1上方草地里遇得
NO.378土雷兽:在双子岛遇得
NO.379天雷兽:在无人发电站遇得
NO.380:木皮怪在岛7最下方海里遇得
NO.381雄奇怪:同NO.380
NO.382奇奇兽:在双子岛钓得
NO.383古拉怪:在1号岛火焰山地下抓
NO.384木木兽:在冠军之路第2层抓
NO.385月映兽:在幽灵塔顶楼遇得
NO.386拉奇:在幽灵塔打嘎拉嘎拉那一层遇到
叶绿386三神兽在狩猎区都能碰到,但是都是5级的
243雷皇分布在サファリゾーソ（狩猎区）一区草丛，遇见率约为5%
244炎帝分布在サファリゾーソ（狩猎区）二区草丛，遇见率约为5%
245水君分布在サファリゾーソ（狩猎区）三区草丛，遇见率约为5%
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