细胞质(cytoplasm)是由细胞质基质、内膜系统、细胞骨架和包涵物组成，包括线粒体、叶绿体、质体，内质网、高尔基体、液泡系(溶酶体、液泡)细胞骨架(微丝、微管、中间纤维)中心粒以及周围物质等。
线粒体，或细胞进行有氧呼吸的主要场所，使细胞内提供能量的“动力工厂”在光学显微镜下观察，大多成椭球形，由内外两层膜构成，内膜上有脊，里面有基质。线粒体中有少量DNA 和RNA。
内质网，一种表面光滑，一种粗糙，上面附着核糖体。是由膜结构连接成的网状物。是蛋白质的运输通道。内质网是有机物合成的“车间”。
叶绿体，进行光合作用的细胞器。内部含有几个道几十个基粒。每个基粒都是由一个个囊状结构堆叠而成的。叶绿体中含有少量的DNA和RNA。
内质网，一种表面光滑，一种粗糙，上面附着核糖体。是由膜结构连接成的网状物。是蛋白质的运输通道。内质网是有机物合成的“车间”。
高尔基体，单层膜网状结构，本身没有合成蛋白质的功能，但可以对蛋白质进行加工和转运，有人把它比喻成蛋白质的“加工厂”。植物细胞分裂时，高尔基体与细胞壁的形成有关。
中心体，动物细胞和低等植物中有中心体。通常位于细胞核附近。每个中心体有两个相互垂直摆列的中心粒及其周围物质组成。动物细胞的中心体与有丝分裂有关。
核糖体，有些附着在内质网上，有些游离在细胞质基质中，是细胞内合成蛋白质的场所，是蛋白质的“装配机器”。
液泡，植物细胞之中的泡状结构，成熟的植物中的液泡很大。表面有液泡膜，液泡内有细胞液，其中含有糖类，无机盐，色素和蛋白质等物质。