一般来说，急性菌痢到医院检查就可确诊。只要治疗及时得当，多可在1~2周内痊愈。症状轻者可在家里隔离治疗。但如患者出现泻吐频繁、头疼、精神状况差、眼窝凹陷、口唇及黏膜干燥、尿量明显减少、四肢末梢发凉、血压下降或升高，甚至出现惊厥抽搐、昏迷等情况时，应立即送往医院救治。
成人一般可先服黄连素0.5克，每日2次；儿童每日300毫克/千克，分2次服，5~7日为1个疗程。如1~2天不见好转，应去医院进一步诊治。
细菌性痢疾主要是抗菌药物治疗。常用的药物有：诺氟沙星，每次0.4克，每日2次；儿童每日15~20毫克/千克，分2次服，5~7日为1个疗程。氧氟沙星，每次0.3克，每日2次；儿童每日10~15毫克/千克，分2次服，5~7日为1个疗程。环丙沙星，每次0.2~0.25克，每日2次；儿童每日10~15毫克/千克，分2次服，5~7日为1个疗程。洛美沙星，每次0.2~0.4克，每日2次；儿童每日10~15毫克/千克，分2次服用，5~7日为1个疗程。但儿童一般不使用上述几种药物，因在动物试验中发现，喹诺酮类药物对幼畜的肢芽发育有影响。成人患细菌性痢疾后，一般可先口服氧氟沙星或环丙沙星，如48小时后体温仍不下降、大便次数仍不减少，应改用注射头孢噻肟钠或头孢曲松钠等药物，其具体剂量及用法按医嘱。
有的病人腹泻比较厉害，应及时补充水和电解质，因此应多喝水，水里可放些盐、糖。