1、阿笠博士（柯南自己告诉他的，第2集）董事长千金绑架事件
剧情简介：趁警察不注意工藤逃到阿笠博士那里寻求帮助，这时担心工藤的小兰找也找到这里，为保护小兰安全，工藤隐瞒身份并在情急之下取名江户川柯南，阿笠博士将柯南托付给小兰照顾，回家后他们碰到了急匆匆出门办案的毛利小五郎，听说有黑衣人，柯南也跟着一起去。原来是董事长女儿谷晶子被绑架，在管家承认了自己是犯人且没有同伙后，却再次有人打来威胁电话…
2、工藤夫妇（由阿笠博士转告，第43集）江户川柯南诱拐事件
剧情简介：某日，一个自称柯南妈妈的陌生女人来接他，柯南第一反应就是她可能是黑衣组织的人，因为她清楚柯南家的底细以及他的真实身份，期间，柯南虽趁机逃脱，但去找阿笠博士的时再次候被抓，他听到了那个女人和一个面具男讨论交易药物的事情，待他们离开后柯南按照那伙人留下了线索找到交易地点，可不幸的是他行迹暴露，面具人对他枪口相向…
3、服部平次（逼柯南亲自承认，第58集）福尔摩斯迷杀人事件(下集)
剧情简介：并且否定了凶手是老板的猜测，而刚才的停电也是人为的。期间，服部一直很在意柯南的种种反应，对柯南产生了怀疑。事件渐渐明晰，服部和柯南知晓了凶手是谁以及他杀死老板和绫子的手法。为了保护自己是工藤的秘密，柯南将服部麻醉说出真相，可让他没想到的是，就是这个举动让服部肯定了柯南就是工藤。
4、宫野明美（柯南亲口承认，第128集）黑暗组织十亿元抢劫事件
剧情简介：某天，柯南发现有人正在抢劫运钞车，虽然奋力追赶，但还是让抢匪驱车逃跑，之后，警方发现抢匪的车并认定这是一起单纯地抢劫事件。可事情并未就此结束，参与抢劫的两名抢匪被杀，并在凶案现场发现了银行职员广田亚美的口红，虽然亚美嫌疑最大但案件还有许多疑点，这时，柯南意识到她有危险，用发信器追踪到达后亚美已死，而这件事的幕后黑手居然是…
5、灰原哀（通过调查察觉，由阿笠博士告知，第129集）大学教授杀人事件(之一)
剧情简介：柯南的班级转来了一个叫灰原哀的女生，而同一天少年侦探队也收到了同校俊野帮忙找哥哥的委托，大家一起去俊野家进行调查，发现了一张夏目漱石的肖像画，俊野说曾有一个黑衣女人很赏识这幅画，听到这些，柯南马上联想到了黑衣组织，便急忙带领侦探队走街串巷的寻找线索，期间，在便利店遇到的一个使用假钱的男子引起他的注意...
6、贝尔摩德（被工藤新一和毛利兰救下得知身份，第288集）工藤新一的纽约事件(解决篇)
剧情简介：之后，新一又对舞台重新进行调查，并注意到了舞台的活动机关，如果利用这个的话凶手及其犯案手法都不难推断，他将事情的真相告诉有希子，由她揭穿凶手，然而，在凶手被警方带走前却说了一句让小兰很介意的话。案子结束后，小兰不小心弄丢了莎朗送给她的手帕，没想到两人找手帕的时候遇到了…
7、本堂瑛佑（设计逼柯南亲口承认，第508集）卡拉OK包厢的死角(下集)
剧情简介：警察分别对接近过死者的几位嫌疑人进行侦讯，又对他们的包厢展开了搜查，试图在这其中找到消失的凶器，然而却一无所获，期间，警方冲洗出了受害者相机中的照片，发现全都是以园子为主进行拍摄的，就在嫌疑人吵闹着要离开之际，柯南将园子麻醉道出真相。回家的路上，英祐告诉柯南自己将离开日本前往美国，并且他还证实了柯南就是新一的猜想。
8、怪盗基德（扮成新一帮他逃过小兰的怀疑得知，剧场版《世纪末的魔术师》）
剧情简介：《名侦探柯南：世纪末的魔术师》是日本东宝公司于1999年4月17日出品的一部动画电影。该片是《名侦探柯南剧场版》的第三部。该片主要围绕着罗马诺夫王朝的秘宝“记忆彩蛋”意外的在日本发现，柯南与老对手怪盗基德、以及神秘第三方之间对彩蛋展开的争夺战。
1.阿笠博士
【柯南自己告诉他的（TV 02）】
2.工藤夫妇（工藤优作、工藤有希子）
【由阿笠博士转告（TV 43）】
3.服部平次
【在事件中察觉，逼柯南亲自承认（TV 58）】
4,宫野明美（已死）
【柯南亲口承认（TV 128）】
5.灰原哀（宫野志保）
【通过调查察觉，由阿笠博士告知（TV 129）】
6.贝尔摩德
【年轻时是有希子的朋友，见过新一小时候照片】
7.本堂瑛佑
【推理得知，设计逼柯南亲口承认（TV 508）】
8.冲矢昴
【注意到以新一声音向小兰打电话的柯南，并说：“原来是这样啊…”但尚未揭穿（漫
画File.813《金一君》）】
9.怪盗基德（黑羽快斗）
【在假扮白鸟监视柯南发现，并且为了还柯南救他鸽子的情，扮成新一帮他逃过小兰的怀疑。（M 3《世纪末的魔术师》）】
10.诺亚方舟（即泽田弘树，已死）
【通过柯南脑中资料得知（M 6《贝克街的亡灵》）】
11.Irish（爱尔兰，黑衣组织成员。已死）、
【通过指纹对比发现，没有报告组织（M 13《漆黑的追踪者》）】
12.鲁邦三世、次元大介、石川五右卫门、峰不二子
【原因不详（《鲁邦三世VS名侦探柯南》，由柯南制作委员会与鲁邦三世制作委员会合作推出）】
下面这几个是有争议的，目前并没有明文说这几位知道柯南就是新一，但是如果他们对柯南身份好奇去调查是可以轻而易举调查出柯南=新一的
1.茱蒂·斯泰琳
【猜测。FBI成员。FBI在追查黑暗组织时，她与其他同事潜入贝尔摩得藏身的暗室，看到了贝尔摩得的飞镖靶上有柯南的照片上写着“Cool Guy”。但她还在TV 345中问贝尔摩得“柯南那个孩子的确很聪明，但他只是个孩子不是吗？”贝尔摩得未回答。可以看出茱蒂知道柯南很聪明，但是尚未明确怀疑他的真实身份】
2.赤井秀一
【猜测。FBI成员，情报搜集能力和推理能力都很强。很信任柯南并与之通力合作，因此可能调查过柯南身份。如果认为冲矢昴就是秀一，则已经明确得知，但目前尚未证明这一点】
3.高木涉
【猜测。曾见过新一，如TV 162等集。TV304中，柯南和高木警官被困在东京铁塔里拆弹。在炸弹要爆炸前，高木警官和柯南都准备为市民献出自己的生命的时候，高木就开始怀疑柯南的身份了。他问了柯南“你究竟是何方圣神？”说明高木警官已经不太相信柯南只是一个普通的小学生了。在TV504里，高木收起了带有柯南指纹的手机。如果他怀疑柯南的身份，有了柯南手机上的指纹，是很容易就能查出来的】
4.佐藤美和子
【猜测。曾在TV 241中怀疑过“沉睡的小五郎”，柯南之后便不在佐藤面前麻醉毛利。TV 302中说过：“说的是柯南吗？他果然不是简单的小孩子。”另外她是高木涉的搭档兼恋人，高木涉如果有什么发现一定会告诉她的】
5.水无怜奈【猜测】
6.白马探
【猜测。TV 473中有对柯南侦探能力的赞赏。但因为他是《魔术快斗》中的主要人物，在《名侦探柯南》中客串，所以可能性很小】
7.毛利小五郎【猜测。这位争议最大·····】
8.伊东末彦【猜测。出自M 10《侦探们的镇魂歌》。虽然利用椅子上的仪器测出了柯南的指纹，但是他也只是知道工藤新一来了，就算后面听出声音稚嫩，也还称其为工藤，即没有发现柯南与工藤新一之间的关联。严格来说并不能算是。】
9.世良真纯
【有证据表示新一和小兰之前很有可能见过世良真纯（柯南对她的小虎牙很熟悉，小兰觉得在海边见过她）；在漫画846话的最后柯南悄悄的问世良：“你和我在哪里见过吗？”世良的心里想：“很抱歉，那可不能告诉你哟，现在还不是时候……”不仅表示世良可能见过新一，而且世良知道柯南身份的可能性增大，更很可能了解柯南更多的秘密。】
10.安室透（波本）
【漫画852话中，贝尔摩得与安室透（波本）化妆成案件知情人混入柯南与茱蒂身边，窃听到了关于柯南帮助FBI的事情以及赤井秀一“殉职”的相关细节······柯南的身份在波本那里已经暴露，预计波本将把注意力从雪莉那里转向柯南······】
希望可以帮到你！满意请采纳~有问题请追问~本回答被网友采纳
注：此部分只收录《名侦探柯南》漫画原作OP/ED/剧场柯南形象(10张)、TV版中明确得知柯南身份的人。
1.阿笠博士：由柯南告知（TV 2）
2.工藤夫妇：阿笠博士转告（TV 43）
3.服部平次：柯南推理能力太强，且柯南把他射晕，中途醒来，后逼柯南承认（TV 58）
4,宫野明美（已故）：临死前问柯南到底是谁，柯南答：“工藤新一，是个侦探。”（TV 128）
5.灰原哀（宫野志保）：在搜查中发现工藤小时候的衣服全都不见了，怀疑工藤新一并未死去，之后由阿笠博士告知（TV 129）
6.贝尔摩德：有希子的密友，因此见过新一小时候照片。TV 339中她在博士家安装窃听器，TV 345里发给柯南的邀请信的署名为“新一”，称其为“银色子弹”。但因为曾经被新一、小兰所救（详见TV 288），感恩新一，并且对组织有所不满所以故意向组织隐瞒。也因此极力保护柯南和兰。7.本堂瑛佑：推理得知，设计逼柯南亲口承认（TV 508）
8.冲矢昴：在注意到新一声音向小兰打电话的柯南后得知，但尚未知道工藤新一服药变小。（漫画File.814《你是柯南吧？》）
其他作品
注：此部分收录非《名侦探柯南》原作的动画作品（如剧场版、特别合作篇等）中，得知柯南身份的人物。
1.怪盗基德（黑羽快斗）M 3中假扮白鸟监视柯南，窃听柯南与阿笠博士的对话得知。并为了还柯南救他鸽子的情，扮成新一帮他逃过小兰的怀疑。（注：《名侦探柯南》漫画原作中未表现出基德知晓柯南身份）
2.诺亚方舟（即泽田弘树，已故）：读取柯南脑中资料得知（M 6）
3.Irish（爱尔兰。黑衣组织成员，已死）：搜集指纹资料对比得知，没有来得及报告组织便被杀（M 13）
争议人物
下面这几个是有争议的，目前并没有明文说这几位知道柯南就是新一，但是如果他们对柯南身份好奇去调查是可以轻而易举调查出柯南=新一的。
1.茱蒂·斯泰琳（猜测。FBI成员。FBI在追查黑暗组织时，她与其他同事潜入贝尔摩得藏身的暗室，看到了贝尔摩得的飞镖靶上有柯南的照片上写着“Cool Guy”。但她还在TV 345中问贝尔摩得“柯南那个孩子的确很聪明，但他只是个孩子不是吗？”贝尔摩得未回答。可以看出茱蒂知道柯南很聪明，但是尚未明确怀疑他的真实身份）2.赤井秀一（猜测。FBI成员，情报搜集能力和推理能力都很强。很信任柯南并与之通力合作，因此可能调查过柯南身份。如果认为冲矢昴就是秀一，则已经明确得知，但目前尚未证明这一点）
3.高木涉（猜测。曾见过新一，如TV 162等集。TV304中，柯南和高木警官被困在东京铁塔里拆弹。在炸弹要爆炸前，高木警官和柯南都准备为市民献出自己的生命的时候，高木就开始怀疑柯南的身份了。他问了柯南“你究竟是何方圣神？”说明高木警官已经不太相信柯南只是一个普通的小学生了。在TV504里，高木收起了带有柯南指纹的手机。如果他怀疑柯南的身份，有了柯南手机上的指纹，是很容易就能查出来的）
4.佐藤美和子（猜测。曾在TV 241中怀疑过“沉睡的小五郎”，柯南之后便不在佐藤面前麻醉毛利。TV 302中说过：“说的是柯南吗？他果然不是简单的小孩子。”另外她是高木涉的搭档兼恋人，高木涉如果有什么发现一定会告诉她的）
5.水无怜奈（猜测）
6.世良真纯（猜测，可能性较大。TV 646中，初登场便叫出柯南名字，并说：“和这孩子一样是侦探。”TV 647中虽然推理失败，但应该是故意为之，观察柯南的行动，还在电话中问工藤现场的情况，在现场的“工藤”（柯南）回答他不在现场所以无法确认。还有诸多细节暗示她有可能调查柯南的事情。TV 651服部与工藤的推理对决中，世良看出柯南已经知道事件真相时说：“看来胜负已分了呢。”表现出她已相信柯南就是工藤，但无确凿证据）7.白马探（猜测。TV 473中有对柯南侦探能力的赞赏。但因为他是《魔术快斗》中的主要人物，在《名侦探柯南》中客串，所以可能性很小）
8.毛利小五郎（猜测。但具有较大争议。详情见“毛利小五郎”词条）
9.伊东末彦（猜测。出自M 10《侦探们的镇魂歌》。虽然利用椅子上的仪器测出了柯南的指纹，但是他也只是知道工藤新一来了，就算后面听出声音稚嫩，也还称其为工藤，即没有发现柯南与工藤新一之间的关联。严格来说并不能算是。但在柯南圈中一直存有争议，估且取其中，算作争议组成员）
10.安室透（猜测，怀疑。File.827中表示对柯南产生浓厚的兴趣。）
参考资料：http://baike.baidu.com/view/26243.htm
希望对你有帮助。
柯南本人TV1（自己应该知道自己是工藤新一吧！）
阿笠博士TV2
工藤优作TV43
工藤有希子TV43
服部平次TV58
宫野明美TV128
灰原哀TV129
贝尔摩德TV345
高木涉TV504（存在猜测，TV329、504 拥有柯南指纹，只要一查验就明白）
本堂瑛佑TV508
冲矢昴（赤井秀一）TV691
世良真纯（虽然没有明确表示，但是大家都看的明白）
上述原著,下面是ova、剧场版、特别篇等其他作品
怪盗基德M3
诺亚方舟M6
Christies YP M8特点（阿里博士往里输入柯南的资料，应该也算）
伊东末彦M10（通过指纹识别器得知）
爱尔兰M13
鲁邦三世《鲁邦三世VS名侦探柯南》
次元大介《鲁邦三世VS名侦探柯南》
石川五右卫门《鲁邦三世VS名侦探柯南》
峰不二子《鲁邦三世VS名侦探柯南》
我就知道这20个，如果有新的，我会马上往上加的