母珠，俗称“三通”或“佛头”，通常只有一颗，但亦有两颗的，用以将不同数目的子珠归结于一处，同时还可以起到连接弟子珠、记子留和一些饰物的作用。旧时的母珠，多会在内部绘有佛像，采用凸透镜的原理，可以清晰地观察到里面的佛像，更加使人感受到佛珠作为一种法具的庄严。
每串佛珠都由一定数目的子珠串缀而成，子珠数目随所据经典不同，表征不同的含义，兹列表如下：
佛珠从上面的表格可以看出，佛珠子珠数目在经典中差异很大，共有九种之多。其实，佛珠有不同的颗数，是因为具有不同的含义，下面就根据普遍流传的说法，将其不同的含义略述如下：
一百零八颗是最为常见的数目，为了表示求证百八三昧，断除一百零八种烦恼，从而使身心能达到一种寂静的状态。百八烦恼的内容，有多种不同的说法，总的来说，六根各有苦、盯茄乐、舍三受，合为十八种；又六凯配察根各有好、恶、平三种，合为十八种，计三十六种，再配以三世，合为一百零八种烦恼。
如经中所言：诸菩萨问：云何百八？佛言：有所念，不自知心生心灭中有阴有集，不知为痴，转入意地亦如是，识亦如是，是为意三。见好色、中色、恶色，不自知著不自知灭有阴有集，乃至触亦如是。彼经但列六根各六，虽无三世之语，而结云百八，故知是约刹那而为三世也。既以心意识三为意地三，故通三世，如云集起名心、筹量名意、别知名识。意三既尔，故使所依五根亦尔。三世三个三十六故，故有百八。
经书所载的挂珠、持珠及念珠的颗数大致分为108颗 ，表示十法界各有一百零八种烦恼，合成为108种烦恼。十法界包括迷的六界，即地狱、饿鬼、畜生、修罗、人间及天上，是六道轮回的世界。后四界是圣者悟的世界，即声闻、缘觉、菩萨及佛界。
一千零八十颗按天台宗理论，十界无不性具善恶，故一千零八十数目表示十界各有一百零八种烦恼，合成一千零八十种烦恼。“十界”表示整个迷与悟的世界，即：1、地狱界，2、饿鬼界，3、畜生界，4、修罗界，5、人间界，6、天上界，7、声闻界，8、缘觉界，9、菩萨界，10、佛界。
五十四颗表示菩萨修行过程中的五十四个位次，其中包括十信、十住、十行、十回向、十地五十阶位，再加上四善根位。分述如下：
十信：1．信心，2、念心，3、精进心，4、慧心，5、定心，6、护法心，7、回向心，8、戒心，9、舍心，10、愿心。
十住：1．初发心住，2、治地住，3、修行住，4、生贵住，5、方便具足住，6、正心住，7、不退住，8、童真住，9、法王子住，10、灌顶住。
十行：佛珠1．欢喜行，2、饶益行，3、无瞋恨行，4、无尽行，5、离痴乱行，6、善现行，7、无著行，8、尊重行，9、善法行，10、真实行。
十回向：1．救护一切众生卖链离众生相回向，2、不坏回向，3、等一切佛回向，4、至一切处回向，5、无尽功德藏回向，6、随顺平等善根回向，7、随顺等观一切众生回向，8、如相回向，9、无缚无著解脱回向，10、法界无量回向。
十地：1．欢喜地，2、离垢地，3、发光地，4、焰慧地，5、难胜地，6、现前地，7、远行地，8、不动地，9、善慧地，10、法云地。
四善根：指见道以前，观四谛及修行十六行相以达到无漏圣位的四种修行阶位，包括：1、暖位，2、顶位，3、忍位，4、世第一法位。
四十二颗表示菩萨修行过程的四十二阶位，即十住、十行、十回向、十地、等觉和妙觉。等觉：又作等正觉，即指在内容上与佛相等，而实际修行上比佛略逊一筹者。如欲详细了解，请参阅鸠摩罗什译《仁王般若波罗蜜经·受持品》。妙觉：指觉行圆满之究竟佛果，系由等觉位更断一品之无明，而得此位。
三十六颗无确切的含义，通常皆认为是为了便于携带，遂三分一百零八颗成三十六颗，其中蕴含有以小见大的义理，故与一百零八颗相同。
二十七颗表示小乘修行四向四果的二十七贤圣位，即前四向三果的“十八有学”与第四阿罗汉果的“九无学”。十八有学：1、随信行，2、随法行，3、信解，4、见至，5、身证，6、家家，7、一间(一种)，8、预流向，9、预流果，10、一来向，11、一来果，12、不还向，13、不还果，14、中般涅盘，15、生般涅盘，16、有行般涅盘，17、无行般涅盘，18、上流色究竟。[16]九无学：1、退相，2、守相，3、死相，4、住相，5、可进相，6、不坏相，7、不退相，8、慧解脱相，9、俱解脱相。
二十一颗表示十地、十波罗蜜、佛果。“十地”见“五十四颗”一段，“十波罗蜜”见“弟子珠”一段的介绍，兹不赘述。而“佛果”指达到最究竟成佛的果位。
十八颗俗称“十八子”，此中所谓“十八”指的是“十八界”，即六根、六尘、六识。六根：1、眼界，2、耳界，3、鼻界，4、舌界，5、身界，6、意界；六尘：1、色尘，2、声尘，3、香尘，4、味尘，5、触尘，6、法尘；六识：1、眼识，2、耳识，3、鼻识，4、舌识，5、身识，6、意识。[18]十四颗表示观音菩萨与
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