薪酬是HR工作的最核心的工作。做好薪酬是HR也是系统的一个最重要最基本的功能。勤科薪资管理系统包含不限于下面的功能：
1) 实现薪酬变化项目审批工作流。影响薪酬 变化的因素如：考勤、休假、人员信息变动（工龄、学历变更、职称、执业资格等）、人员信息变更需审批后与工资关联。
2) 通过人力资源系统做薪酬与福利的预算，依据年初的编制、岗位人数和上年的编制、岗位人数编制出当年的薪酬与福利预算。
3) 可建立符合本企业需要的工资结构体系，可以灵活定义工资类别、计算公式和工资标准等。实现计件工资的核算管理，包括产品或工序计件单价与历史单价管理，日计件录入，按品种统计，按个人统计，月计件统计，班级计件等，可将计件汇总与工资无缝结合。实现销售提成工资与绩效工资的核算管理。实现结构工资管理。
4) 员工的入职、转正、异动、离职的工作流与薪资关联，系统可自动完成工资调整业务，自动形成月度薪资异动汇总表，实现对薪资异动表按汇总，不同的部门汇总表走不同的审批工作流程。能够自动记录员工的历次工资变动情况，提供工资补发补扣自动处理机制，变动情况可以归档备查。
5) 实现工资表中社保缴纳名册数据、社保导出名册数据及花名册的自动对比，形成差异分析表。社保和公积金补缴扣款与正常扣款分开，补缴扣款系统能够一次性维护分期扣款。
6) 实现薪资调整批处理或指定个别员工调整薪资。
7) 可统一调整全公司工资，也可进行部分调整；或者可统一及部分应用某个薪资方案，定薪、调薪后可直接应用到薪资核算。
8) 能够选择设置扣税项目。能够方便定义各种税率表，提供合并计税功能，能够生成税表，员工可以在网上查询报税情况。
9) 薪资导出数据与财务向银行报盘格式一致，与税务保税格式一致。
10) 有薪酬数据导入功能，如高温津贴等特殊的一次性补贴，开门红，年终先进奖励（食堂费用、水果）能够使用excel表格导入系统，并计入在员工工资表中。
11) 所有导入薪酬数据通过系统走审批工作流程。
12) 以人为基准，系统支持多部门发薪，如：某员工，多部门（可能有临时项目组）发工资或奖金，能够计入该员工工资福利总额，同时，按支出部门计入部门支出成本。
13) 费用中心区分，薪酬核算类别根据岗位自动分类：管理（行政/生产/销售/研发/年薪制/其他）、生产一线、销售一线、后勤。成本中心区分，与财务系统对接。系统能够按费用中心和成本中心统计。
14) 有工资单生成功能，能够选择员工看到的项目。
15) 可对计算有误的薪资计算进行重算，薪资发放有误的可进行重设置并执行相应处理，计算扣税差额，反映到当月工资当中；需要有校验数据功能。
16) 可方便的与不同考勤机数据对接，能方便导入奖金及其他必要的工资数据等，也可将工资数据输出。
17) 能根据本月工资信息重新核算工资，需要有校验数据功能，支持一月多次发放，可以合并计税。
18) 能够方便地与外部系统（考勤系统、财务系统）和银行等进行数据传递。
19) 提供强大的工资分析功能，可按部门（包括临时部门）、岗位、级别、档次等分析各类工资项目的总额、比例（按规定的项目合计后计算比较）、平均值、最高值、最低值等；提供历史工资分析功能，能以多种形式进行工资增幅的比较分析。
20) 实现系统自动汇总员工个人年度工资和福利的统计报表，按工资和福利项目统计。年度工资总额要大于等于本年度下各期间的工资总额之和。
21) 提供对各薪资类别当前最新期间的查询；可按年月日时间段进行查询并能保存为Excel。
22) 可灵活设置不同类型员工的各类薪资项目及其计算方式。
23) 可自定义薪资计算参数，分别计算各薪资期间薪资类别的每个项目。①工资数据来源，②各个项目之间的逻辑关系。
24) 系统进行期末处理，自动将本月数据结转到下月，并与下月薪资关联。
25) 提供完善的薪资统计分析功能，系统预制多种薪资查询、统计、分析工具，为制定薪资制度与调整薪资结构提供依据。
26) 提供常用的各类工资报表并可生成不同格式的薪资明细报表和各类统计报表。
27) 数据监测：能够实现适时对各部门的成本，个人的收入情况进行检测。
28) 薪资发放表中提供对各薪资项目是否显示的设置，不发放的期间可设置该项目不显示。
29) 查询的时间范围：开始日期缺省为当前期间的起始日期，截止时间为期间结束日期，用户可以对时间范围进行调整。
30) 实现员工网上查询个人当月薪资及薪资历史情况。
31) 可根据员工考勤情况及绩效，自动计算工资、绩效奖金、绩效工资等。
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