1、在功能模块上的区别
金蝶k3wise与金蝶k3cloud均是主要适用于制造类企业，并且都强调了供应链的协同和财会管理和制造管理。
2、在适用企业类型上的区别
金蝶k3wise更适用于中型企业，而金蝶k3cloud则更适用于年产值5亿以上的多组织企业。
3、在产品定位上的区别
金蝶k3wise关注解决的重点在于“智造”——如何提升制造类企业制造管理环节的效益，而金蝶k3cloud关注的重点在于通过云平台“BOS平台”解决多组织架构间的关联性和管理问题——如何通过协调各部门、各地域、各个生产制造的环节来提升整体的效率及竞争力。
4、在产品预算上的区别
以下数据来自于《金蝶K/3WISE创新管理平台V14.0系统标准许可报价》以及《金蝶K/3CloudV3.0标准报价》，特别说明：金蝶k3cloud最新版本为金蝶K/3CloudV5.0。
以两者产品各模块中用户单价的区别为例，如下所示：
金蝶k3wise各模块的用户单价如下
财务会计==5，000元
管理会计（集团）==18，000元/10，000元（业务预算费用预算资金预算）
供应链==8，000元
人力资源==9，000元/18,000元（招聘选拔培训发展绩效管理素质模型）
生产制造==18,000元
客户关系管理==5,000元
金蝶k3cloud各模块的用户单价如下
财务会计=36,000元
制造==36,000元
供应链==36,000元
BOS平台==5,000元