名义上书记大，实际上校长大。现在高校基本实行的都是校长负责制，校长一般分管学校的办公室、人事、财务、招生与就业等核心部门，而书记通常只分管干部培养、考察、学生的政治思想教育工作。
根据《中国共产党普通高等学校基层组织工作条例》和《中华人民共和国高等教育法》规定，在认真总结历史经验基础上提出的中国高等学校的领导体制。党委领导下的校长负责制是中国共产党对普通高等学校领导的根本制度，是高等学校坚持社会主义办学方向的重要保证。
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校长是学校的法定代表人，在学校党委领导下，贯彻党的教育方针，组织实施学校党委有关决议，行使高等教育法等规定的各项职权，全面负责教学、科研、行政管理工作。党委领导下的校长负责制是一个不可分割的有机整体。
坚持和完善党委领导下的校长负责制，必须坚持党委的领导核心地位，保证校长依法行使职权，建立健全党委统一领导、党政分工合作、协调运行的工作机制。要合理确定领导班子成员分工，明确工作职责。领导班子成员要认真执行集体决定，按照分工积极主动开展工作。
参考资料来源：百度百科-高校党委领导下的校长负责制
校长才是最重要的负责人。在党务部门，书记是大官，书记一般只负责组织工作，政治工作，原则上对本部门的重大工作有最终决定权。
小学和中学，校长是学校的校长。在高校中，总统在党委的领导下负责系统，总统一般担任学校党委副书记，是第二手。就像各级政府机构一样，秘书是第一，政府首脑是第二。
而在中小学中，是实行校长负责制的，校长是学校行政管理的最高负责人。校长全面领导学校的行政、人事、教育、科研等工作。他是学校的法定代表人和校长。而书记只负责思想政治教育，负责党建工作，正常情况下是学校的第二指挥，与校长的行政级别是相同的。
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校长是学校的法定代表人，是学校行政管理的负责人。他对学校的工作负全责。认真贯彻党和国家的教育方针、政策，贯彻国家和高等教育领导机关的法律、法规和指示，依照教育法律办事，依法办学；从学校实际出发，完成学校的工作任务。
学校秘书的工作主要是认真贯彻相关文件和上级党组织的指示，确保学校的方向的监督，并负责建设领导小组和教职员的建设。密切关注学校教职工的政治学习和思想政治工作，稳定学校教职工队伍。
参考资料来源：百度百科－校长
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校长权力大，名气大本回答被提问者采纳