镜质体反射率是标志有机质成熟度的重要指标，在同等演化程度下，煤的反射率高，泥岩次之，碳酸盐岩最低。通过盆地内38块样品所进行的镜质体反射率测定，最小值为0.55%，最大值为1.04%。Ro＞0.57%的大多数样品基本上都分布半深湖区，其中E2n1-1段的高值区位于田东凹陷的韦宁—那旺—东达一线（百70井的为0.82%，百20井的为0.68%，法11井的为0.61%）及田阳凹陷的百果一带（果1井的为0.66%）。E2n1-2段的高值区位于田东凹陷的韦宁—那旺（百70井的为0.80%，百20井的为0.63%，百57井的为0.61%）及马鞍山北（法12井的为0.64%）地区。E2n2段的Ro高值区均分布在盆地中心部位的韦宁—那旺—怀吉一带（百70井的为1.04%，百12井的为0.98%，百20井的为0.71%，法12井的为0.71%）。总体上，那读组大部分烃源岩处于低熟至成熟阶段，坳陷中心少量烃源岩进入中高成熟阶段。
一般情况下，在连续沉积的地层中，镜质体反射率是随深度增加而连续增大，但是有机质类型可能也有一定的影响。如图3.7所示，百岗组与那读组及其之上地层有机质的热演化趋势是连续的，那读组有机质的热演化趋势也是连续的，但两条趋势线在那读组与百岗组分界处发生反向错动，表现为新地层镜质体反射率明显大于老地层的镜质体反射率，造成这种现象的可能原因是上下层位之间有机质类型的明显差异所致，那读组有机质菌藻类生源相对丰富，镜质体热演化可能受到一定程度的抑制作用，而百岗组地层有机质以高等植物占绝对优势，镜质体热演化不受这种抑制作用的影响。
图3.7 百70井Ro与深度关系曲线