为了有效防治龙眼叶枯病，首先，关键在于提升果树的管理。通过加强树势培养，增强其自身的抗病能力，确保其健康生长。
其次，良好的果园生态环境对防治疾病至关重要。实施定期修剪，去除病虫枝和生长不良的弱枝，以促进空气流通和充足的光照，这样可以改善整体的果园环境，减少病害的滋生地。同时，及时清理病枝和落叶，减少病原体初次侵染的机会。
在药物防治方面，对于叶斑病高发地区，应在病害初期采取措施。常用的药剂有1%的波尔多液，可以以800~1000倍的浓度喷洒；还有70%甲基托布津可湿性粉剂，可使用600倍液进行喷洒，如50%退菌特可湿性粉剂。这些药剂能有效抑制病菌的繁殖，降低病害的发生率。
龙眼褐色叶枯病（Phomopsis Longanae）和灰色叶枯病（Phomopsis guiyuan）是龙眼常见的叶片病害，在我省广州、从化、中山、高州、汕头、惠州等市均有发生。