华中科技大学东莞研究院的办学定位以东莞市和泛珠三角地区为核心，致力于满足机关事业单位及科技企业的教育与培训需求。借助华中科技大学的强大师资力量，研究院致力于构建一个服务于地方的知识和科技交流平台，为区域经济发展提供在职培训和技术支持。
研究院的教育模式强调个人综合素质的全面提升，实行院企深度合作，工学紧密结合，旨在培养一批具备高素质的技能型专门人才，能在生产、建设、服务和管理的一线岗位上发挥重要作用。这些人才将专注于一线操作，同时也是管理和服务的专家。
在研究生教育方面，研究院提供了多样化的专业选择，包括软件工程硕士、公共管理硕士（MPA）、工商管理硕士（MBA）、法律硕士（JM）、公共卫生硕士（MPH）、项目管理硕士、环境工程硕士、机械工程硕士、工业工程硕士、建筑工程管理、城市规划设计、风景园林硕士以及社会工作硕士等。值得注意的是，公共管理硕士、工商管理硕士以及社会工作硕士都设有双证课程，以满足更高层次的学术需求和职业发展。
华中科技大学东莞研究院作为率先进入东莞市中国著名大学科技城的机构，是东莞市政府正式批准成立的事业单位。本着立足东莞，服务于经济建设，依托学校组织项目研发，推动成果转化，发展高新技术产业，加快人才培养，促进“产、学、研”合作。为把东莞建成现代化中心城市和把华中科技大学建成国际知名大学作出贡献。研究院自2001年成立以来，作为华中科技大学在东莞的二级机构，为东莞市的产业升级与人才培养绵尽薄力。