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PCR鉴定微生物,请问一下具体的步骤是什么?
请问比较16sRNA的方法是什么?
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推荐答案 2007-08-11
PCR即聚合酶链式反应是常用的快速扩增基因的方法。
通过PCR可以鉴定到种
具体步骤:
1将培养过的微生物(最好是青年时代的)提取基因组(这步不清楚再问我)
2 通过PCR扩增,
3 测定基因序列
4 和已知的基因图库上的序列比较,就可以确定是哪一个种
不过现在一般不采用基因组来比较,这样工程量太大。比较16SRNA是比较常用的方法。相对简单,准确度高。
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其他回答
第1个回答 2007-08-11
简单的说就是提取基因组,然后用专门的特异性引物作PCR,得到大约1k多的产物,如果条带清洗,可以直接拿去测序,也可以作TA克隆以后测序,然后作序列比对,NCBI blast之类的
要看你所检验的时微生物的什么基因了
比如说是基因组还是mRNA还是16sRNA
基因组简单,直接提取基因组DNA作PCR就是了
其实更简单的做法是直接把细菌煮一下裂解,直接作PCR
如果要检验基因转录水平
就要提取mRNA,然后用逆转录酶逆转录出cDNA,然后再PCR
这时候通常要同时做比如说GAPDH的内参
16sRNA就是检验微生物物种所用的
第2个回答 2007-08-11
1 PCR混合物制备,(根据你需要来),然后装管
2 常温随机挑选转化板上的转化子,枪头挑取菌体琼脂板上作单拷贝,(没枪头上牙签),再在刚才的管里洗一洗,板和馆配上号,不然做的多就乱了
3 扔pcr仪里,电泳找片段,有既是阳性克隆
4 建议用通用引物
第3个回答 2007-08-11
先提取DNA,做PCR扩增,再测序
------------------------------------
说起来比较简单,但做比较复杂,,就不展开说了..
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