斜面法保存菌种是实验室和工厂菌种室常用的保藏法，优点是操作简单，使用方便，缺点是保存期短，在不断的传代过程中，菌种容易变异，屡次传代会使微生物的代谢改变，而影响微生物的性状；污染杂菌的机会亦较多。
试管穿刺法是斜面保藏的一种改进方法，常用于保藏各种需气性细菌。方法是将
培养基制成软琼脂（琼脂含量为斜面的1/2，一般为1%），盛入1.2×10cm的小试管或螺旋口小试管内，高度为试管的1/3。121℃高压灭菌后不制成斜面，用针形接种针将菌种穿刺接入培养基的1/2处。培养后的微生物在穿刺处及琼脂表面均可生长。然后覆盖以2~3mm的无菌
液体石蜡。液体石蜡必须高压灭菌2次。这样的
小管可在冰箱中保存以减少微生物的
代谢作用。因此保藏效果较斜面为好。如果不用穿刺法而直接将液体石蜡加入生长好的斜面上亦可得到相似的效果，而且适用的范围较广，真菌放线菌都可适用。