从医学角度看，
胃镜肠镜检查并没有很大痛苦，胃肠道属于内脏，内脏性疼痛都不是很严重，更多的人恐惧和不适感。而骨髓穿刺所经过的皮肤和骨膜却有很灵敏的痛觉感受器，如果不加以
麻醉会非常痛苦。
因此，大多数检查胃镜或者肠镜的人都不需要麻醉，只有少部分恐惧心理比较重，才会选择无痛胃镜、无痛肠镜。
但是，骨髓穿刺如果选择不麻醉，那是无法忍受的痛苦，俗话说痛彻骨髓就是这个道理。不过骨髓穿刺麻醉比较简单，局部浸润麻醉就可以完成，只要局麻到达骨膜，疼痛就会被避免，操作也很简单。
无痛胃肠镜麻醉通常选择静脉复合麻醉，也就是
全麻，比较贵，风险也比局麻高，而胃肠镜大多数人不需要麻醉就可以顺利进行。
因此单就痛苦而言，骨髓穿刺痛苦比较明显一些。