一、性质不同
1、地基处理：用于改善支承建筑物的地基（土或岩石）的承载能力或改善其变形性质或渗透性质而采取的工程技术措施。
2、桩基础：通过承台把若干根桩的顶部联结成整体，共同承受动静荷载的一种深基础，而桩是设置于土中的竖直或倾斜的基础构件。
二、作用不同
1、地基处理：提高地基承载力，保证地基稳定等。
2、桩基础：作用在于穿越软弱的高压缩性土层或水，将桩所承受的荷载传递到更硬、更密实或压缩性较小的地基持力层上。
三、方法不同
1、地基处理：填垫层法、强夯法、砂石桩法、振冲法、水泥土搅拌法、高压喷射注浆法、预压法、夯实水泥土桩法、水泥粉煤灰碎石桩法、石灰桩法、灰土挤密桩法和土挤密桩法、柱锤冲扩桩法、单液硅化法和碱液法等。
2、桩基础：可以是单根桩（如一柱一桩的情况），也可以是单排桩或多排桩。对于双（多）柱式桥墩单排桩基础，当桩外褥枉地而上较高时，桩间以横系梁相连，以加强各桩的横向联系。
参考资料来源：
地基处理一般是指用于改善支承建筑物的地基(土或岩石)的承载能力或改善其变形性质或渗透性质而采取的工程技术措施。
桩基是指由桩和连接桩顶的桩承台(简称承台)组成的深基础(见图)或由柱与桩基连接的单桩基础，简称桩基。若桩身全部埋于土中，承台底面与土体接触，则称为低承台桩基;若桩身上部露出地面而承台底位于地面以上，则称为高承台桩基。建筑桩基通常为低承台桩基础。高层建筑中，桩基础应用广泛。
由上可知，桩基和地基处理并不是一个概念的事情。根据《建筑工程施工质量验收统一标准》中分部分项划分表中可知，打桩是属于地基与基础分部工程中的桩基子分部工程，并不属于地基处理施工，具体划分情况见下表：
建筑工程共包含十大分部，其中地基与基础属于其中的重点分部工程，其包含的子分部工程有：无支护土方、有支护土方、地基处理子分部工程、桩基、地下防水、混凝土基础子分部工程、砌体基础、劲钢（管）混凝土 、钢结构。