1913年，横川定因发现横川氏吸虫而获奖。
1958年，钴六十治疗开始作业。
1963年，首批赴利比亚医疗队启程；施行台湾首次血液透析。
1964年，开始使用腹膜透析治疗尿毒症病人；首例开心手术由林天祐等人完成。
1967年，开始使用人工洗肾机进行血液透析。
1968年，首例临时性心律调整器装置完成；首例活肾移植手术完成。
1968年，首例活肾移植手术完成。
1969年，首例永久性心律调整器装置完成；首例尸肾移植手术完成。
1969年，首例尸肾移植手术完成。
1971年，完成首例义肢装置。
1973年，完成首例冠状动脉绕道手术。
1979年，澳底社区医疗保健实验中心成立，为本院与基层医疗合作之始；
1979年，首批中沙医疗团服务人员启程前往沙国；
1979年，连体婴忠仁忠义分割成功。
1983年，完成台湾地区首例骨髓移植手术（自体骨髓移植）。
1984年，完成首例异体骨髓移植手术。
1986年，本院发现台湾地区第一例后天免疫不全症（AIDS）病例。
1987年，完成台湾地区首例换心手术；
1987年，首例试管婴儿诞生；
1987年，体外震波碎石机启用。
1989年，台湾地区首例冷冻胚胎试管婴儿诞生。
1992年，完成首例小儿肝脏移植手术。
1994年，首例人工电子耳植入完成；
1994年，施行全球首例胎儿腹水抽取术；
1994年，台湾地区首例连环式换心手术完成；
1994年，早产儿胸腹连体婴儿分割完成，创体重最轻之世界纪录。
1995年，台湾地区首例植入式心脏整流去颤器（ICD）手术完成；
1995年，台湾地区首例胰脏移植成功；
1995年，成立缓和医疗病房；
1995年，协助越南完成首例骨髓移植。
1995年，完成台湾地区首例肝肾并植、
1995年，首例活体肝脏移植、
1995年，首例右心室辅助器植入、
1995年，首例双心室辅助器植入手术。
1996年，国内首次由殖入人工心脏（双人室辅助器） 过渡到换心成功，创亚洲首例。
1997年，完成台湾地区首例年龄最小（1岁2个月）的心脏移植手术；
1998年，成功完成世界首例急冻心脏手术；亚洲首例二度换肺手术成功。
1999年，完成国内首例迷走神经刺激术；
1999年，亚洲首例微电极定位治疗巴金森手术。
2003年，发现台湾首例SARS个案并收治最多SARS病人；
2003年，完成全球首例以异体迷你造血干细胞移植术治疗鼻咽癌。
2004年，完成世界体重最轻早产儿（432g）剖腹接肠手术；
2004年，完成台湾地区首例血型不相容活体肾脏移植手术；
2004年，完成国内最轻（1300g）最小（35周）新生儿开心手术。
2006年，国内首例“免切除脾脏之血型不相容肾移植”手术完成。
2007年，李伯皇教授率领肝脏移植团队，协助越南完成首例成人活体肝脏移植。
2007年，完成国内首例，成功地利用双腔式心脏移植手术同时解决上腔静脉病变与严重心脏衰竭。
2007年，与台大医学院药学系合作，首度于国内成功地制作F-18 FLT（fluorothymidine）恶性肿瘤正子扫描剂，并于台湾医用回旋加速器学会发表。此为国内在正子扫描药剂之制作上，首度由前驱物制作至放射标记皆在同一机构完成者。
2008年，以叶克膜（ECMO）支持117天，成功拯救溺水呼吸衰竭病人，为全球使用ECMO最长案例。
2008年，完成亚洲首例借由胚胎?床前基因诊断技术，正确选择出非地中海型贫血又具同型人类白血球抗原（HLA）的胚胎，植入母体后成功怀孕，并顺利产下女婴。
2008年，成功完成无心换心手术，病患在全心脏摘除下，以叶克膜在无心脏状态下维持生命长达16天后，成功完成心脏移植手术。
2009年，针对无法以外科颅内手术或抗癫痫药物，也无法使用生酮饮食来辅助治疗之顽固型癫痫病童，植入儿童型迷走神经刺激器，术后病童癫痫的情况获得大幅改善，此为亚洲首例。
