乳酸菌在常温下只能短时间保存，否则可能变质或活性下降，还是建议低温保存比较好.
如果是乳酸菌饮料，室温保存可以3-5天，时间不宜太长，如果是其他乳酸菌食品，建议冰箱4-5度保存，乳酸菌不宜在室温下保存。如果单单是为了使该菌存活，也最好不要室温保存，因为过了指数生长期后，会渐渐衰老!
1、活性乳酸菌饮料由于含有大量、丰富的活性有益菌，而成为具有保健功能的时尚饮料，备受消费者欢迎。但是，日前，记者走访广州各大超市、商场时，发现很多品牌的活性乳酸菌饮料直接就摆放在货架上、在常温状态下销售。昨日，有关食品专家对此担心地表示，活性乳酸菌饮料必须在冷藏的条件下运输、销售和储存，否则在很短的时间内，里面的活性菌就会大量死亡，从而失去保健功能，甚至可能变成有害无益。
2、活性乳酸菌饮料能否在常温下储存、销售?“活性菌”到底保持多长时间的活性?活菌的数量达到多少才是有益人体?
按照目前乳酸饮料国家标准，活性乳酸菌饮料应储存在2℃-10℃，保存期不少于1个月。据介绍，活性乳酸菌饮料在生产时一般不需要经过高温杀菌，所以在出厂后要冷藏销售、运输和储存，不能常温下存放。因为，在低温的状态下，活性菌活动可受到抑制，否则将会很快大量死亡。同时，也可抑制大肠杆菌、霉菌等细菌繁殖。“像这类食品，最好还是低温保存。”有关专家认为，最标准的储存温度是家庭冰箱里的4℃-5℃。
3、在常温状态下，
保质期长达6个月、9个月是根本不可能的，放一周左右影响不大，但一
周后活性乳酸菌数量就会迅速减少。即使可能保存到一个月，保留在饮料里的活菌量又有多少?据专家介绍，活性乳酸菌具有改善胃肠道功能(调节
肠道菌群、促进消化)的功能，这种活性乳酸菌饮料本身是没有营养的，其蛋白质含量只有1%左右，消费者消费它的主要原因是看中它的保健功能，而活性乳酸菌也只有保持一定数量才能起到调节作用，若没有活菌或活菌量少，就没有任何作用了。
华南理工大学轻工与食品学院副院长赵谋明还表示，在一般的冷藏条件下(约4℃)，一个月后活性乳酸菌的数量将会大量递减，存活下来的数量将会很少。而在常温下这一情况将更严重，两个月还存留的活菌数量更是非常少。