西南大学和西南财经大学的办学历史不同。
一、西南大学
西南大学由原教育部直属西南师范大学与原农业部直属西南农业大学于2005年合并而成。原两校毗邻而建，均溯源于1906年建立的川东师范学堂。
1936年更名为四川省立教育学院。
1950年，四川省立教育学院师范、农学相关系科分别与1940年创办的国立女子师范学院、1946年创办的私立相辉文法学院等合并建立西南师范学院、西南农学院。
1985年，两校分别更名为西南师范大学、西南农业大学。此后，重庆轻工业职工大学、四川畜牧兽医学院、中国农业科学院柑桔研究所相继并入。
二、西南财经大学
学校始于1925年在上海创立的光华大学。
1946年更名为成华大学。
1952至1953年，以成华大学为基础，先后并入西南地区16所院校的财经系科，组建四川财经学院。
1960年分设四川财经学院和四川科学技术学院。
1961年合并更名为成都大学。
1978年恢复为四川财经学院。
1985年更名为西南财经大学。