1)牦牛炭疽
炭疽是由炭疽杆菌引起的急性人、畜共患病。
本病呈散发性或地方性流行，一年四季都有发生，但夏秋温暖多雨季节和地势低洼易于积水的沼泽地带发病多。
多年来，牦牛产区有计划、有目的地预防注射炭疽芽孢茁，取得良好的效果。
由过去的地方性流行转为局部地区零星散发。
发生疫情时，要严格封锁，控制隔离病牛，专人管理，严格搞好排泄物的处理及消毒工作，病牛可用抗炭疽血清或青霉素、四环素等药物治疗。
2)牦牛布氏杆菌病
布氏杆菌病简称布病，是由布氏杆菌引起的人畜共患病。
在牦牛布病免疫学预防方面，先后用布氏杆菌M5号菌苗、19号菌苗、S2号菌苗等进行气雾或饮水免疫；用MB32弱毒菌苗，进行皮下接种，室内、外气雾免疫，免疫期达1年以上。
3)牦牛巴氏杆菌病
巴氏杆菌病又称出血性败血症，是由多杀性巴氏杆菌引起的多种动物共患的一种败血性传染病。
本病的特征，急性经过时呈败血性变化，慢性经过时则表现为皮下组织、关节、各脏器的局限性化脓性炎症。
多呈散发性或地方流行性，一年四季均可发生，但秋冬季节发病较多。
早期发现该病除隔离、消毒和尸体深埋处理外，可用抗巴氏杆菌病血清或选用抗生素及磺胺类药物治疗。
4)犊牦牛大肠杆菌病
犊牛大肠杆菌病是由病原性大肠杆菌（埃希氏大肠杆菌）引起的一种犊牛急性传染病。
临床上主要表现为剧烈腹泻、脱水、虚脱及急性败血症。
犊牦牛大肠杆菌病在牧区普遍存在，多发生于生后1-4日的犊牛。
国内对犊牛大肠杆菌病的治疗方法颇多。
晏哲生等应用抗生素、呋喃类药物和分离的致病株自制高免血清；四川甘孜灌服三颗针液防治犊牦牛下痢；西藏昌都地区用复方黄连治疗犊牛拉稀病，疗效均好。
5)牦牛传染性胸膜肺炎
牦牛传染性胸膜肺炎也称牦牛牛肺疫，是由牛丝菌霉形体引起的一种慢性或亚急性传染病，其特征主要是呈现纤维素性肺炎和胸膜肺炎症状。
我国1958年研制成兔化牛肺疫疫苗，试验证明安全有效，免疫期为一年半。为了适应我国广大牧区不产兔的特点，接着又研制了绵羊反应苗，在牧区推广应用，控制了牦牛牛肺疫的发生。
6)结核病
结核病是由结核分枝杆菌引起的人和畜禽共患的一种慢性传染病。
用结核菌素进行皮内变态反应是诊断牦牛结核病的主要方法。但由于牦牛个体不同，结核菌菌型不同等因素，目前还不能将病牦牛全部检出，有时还可能出现非特异性反应，因此在不同情况下要结合流行病学、临床症状、病理变化和病原学诊断等方法进行综合判断。近年试用荧光抗体技术诊断结核病。
应加强定期检疫，对检出的病牛要严格隔离或淘汰。若发现为开放性结核病牛时，要进行扑杀。除检疫外，为防止传染，要做好消毒工作。犊牛出生后进行体表消毒，与病牛隔离喂养或人工喂健康母牦牛的奶，断奶时及断奶后3-6个月检疫是阴性者，并入健康牛群。
7)犊牦牛弯曲菌病
弯曲菌病又称弯曲菌肠炎，是由空肠弯曲菌引起的一种新的人畜共患急性腹泻病，主要危害幼儿和幼畜。临床上以发热、腹泻、腹痛为主要特征。
试验证明氯霉素、四环素、痢特灵等药物均有明显疗效，酸乳和乳清对犊牦牛弯曲菌病有防治效果。
8)牦牛皮霉菌病
皮霉菌病是由多种皮霉菌引起的畜禽和人的体表质化组织（皮肤、毛发、指甲、爪、蹄等）的传染病，不侵害皮下深层组织。
及时采取正确的治疗，用5%黄霉素液体石蜡油合剂涂擦，每习1次，一般7日可愈。
9)牦牛肉毒梭菌中毒病
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