元配于氏，长子袁克定
大姨太太沈氏，没有子女
二姨太太李氏，长女伯祯、五子克权、七子克齐、十子克坚、十二子克度。六女籙祯
三姨太太金氏。次子克文、三子克良、三女叔祯、八女（早亡）、十女思祯。
四姨太太吴氏。四子克端、次女仲祯（嫁给了两江总督端方的侄子）、四女（早亡）、七女复祯。
五姨太太杨氏。六子克桓、八子克轸、九子克久、十一子克安、五女季祯、十五女（早亡）、九子克久（娶民国黎元洪的女儿为妻）
六姨太太叶氏。十四子克捷、十七子克友、九女福祯、十一女奇祯、十二女瑞祯。
七姨太太张氏。没有子女，
八姨太太郭氏。十三子克相、十五子克和、十四女怙祯。
九姨太太刘氏。十六子克藩，早死；女儿仪祯排行十三，续五姨太的女儿季祯嫁苏州陆状元家。
子
长子克定
次子克文（子：袁家骝1912～2003年 华裔美国物理学家。子媳吴健雄素有“东方居里夫人”之称。）
三子克良
四子克端
五子克权
六子克桓
七子克齐
八子克轸
九子克久
十子克坚
十一子克安
十二子克度
十三子克相
十四子克捷
十五子克和
十六子克藩
十七子克友
女
长女伯祯（成年后嫁与清两江总督张人骏的儿子）
次女仲祯（嫁给了两江总督端方的侄子）
三女叔祯
四女（早亡）
五女季祯
六女籙祯（嫁民国总理孙宝琦的儿子）
七女复祯
八女（早亡）
九女福祯
十女思祯
十一女奇祯
十二女瑞祯
十三女仪祯（续五姨太的女儿季祯嫁苏州陆状元家）
十四女怙祯（怙祯嫁给了民国总统曹锟的儿子，后离婚去了美国）
十五女（早亡）
一妻九妾共生了17个儿子、15个女儿； 17个儿子又为袁世凯生了22个孙子、25个孙女，儿孙总和达79人。
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