清华大学和北京大学各有特色。很难分个高低，也没必要分出高低。适合自己的学校才是最好的。北京大学属于综合的类型。文科和理科（哲学、经济管理、数学、物理、生物等基础科学）是全国最好的。清华属于理工的类型。工科（电气、水利工程建筑、土木工程、经济管理、机械、力学、计算机、电子信息、核能等。）那就当属清华。从政或者企业家感觉清华好，经管方面内行的人喜欢清华，外行的人钟情北大。两个学校的氛围不同：北大强调自由民主兼收并蓄，北大的课外生活很精彩，有129合唱比赛啊、新生杯演讲、体育等各个方面，200多个社团可供选择，让你拥有充实的生活，哦，还有北大图书馆，啊简直是北大最珍贵的资源；清华注重务实严谨，管理严格。读理科的话，还是去读清华吧！如果想读医学，现在北大医学部也不错，P.S.北大的信息科学院、数学系、物理系、化学院都很不错哦。
最近这几年的各种国内外排名来看，综合排名上，北京大学一般是超过清华大学的。当然啦，单从一些排名上来看，浙江大学还有可能是中国最好的大学呢。从基本情况来讲，北大是以文理医为主，清华以工科为主。目前，北京大学的文科、理科和医科的综合实力在全国是首屈一指的，清华大学的工科的综合实力在全国也是遥遥领先的。注意，我这里说的是综合实力，不排除在某些学科上其他高等院校有超越的可能。这里还要再说明一点，很多不关注高等教育的人总认为北京大学的理科很弱，同时社会科学也处于霸主级地位，这个观点明显是错误的。北大在数学、物理、化学、生物上的各科优势还是比较明显的（这几年物理有被南大赶超的趋势，不过还是保持着领先地位），但某些社科类学科人大可能要更胜一筹。以上是做一点点知识普及，这些恐怕大家都通晓。就题主最关心的问题来说，一般国外的教授在审核申请的时候，所在学校往往是第一道关卡，而不是最后一个，这一点虽然对于很多学校的学生不是那么公平，但却是事实。如果这个教授水平较高，申请人数过多的话，他要做的第一件事，就是将学生按学校水平分类，不在top学校的申请者甚至可能直接被踢掉，连申请内容都不看。毕竟国内外但凡有点见识的人都知道，北大清华的本科生质量在全球都能排得上号。我老师跟我讲过前几年他去美帝看望他的博士生导师的时候的事情。老爷子刚打开一份中国学生的申请，顺嘴问了他一下，这个x学校怎么样。他当年做学生的时候也是学神级别的，非常厉害。这所学校其实还是蛮不错的，挺有名气的，好像还是个985或者211，但可能在我老师的眼中比不上p大，他也就随口说了一句，还凑合吧，一般。结果老爷子直接把申请放到了另一摞里。我老师前些天跟我聊的时候，还觉得有愧于那个学生。当然了，这只是个例，那老爷子毕竟是学术界泰斗，招收学生很严格，但院校歧视现象在出国申请中确实存在。
就形而下层面而言，其实两校差不了太多。北大的文科、理科和医科强，清华的工科强。北大综合性强、风格多元，清华注重集体主义，世故些。就形而上层面而言，北大是最高学府出身，最初甚至身兼教育部职能，传承并替代了两千多年的中国最高学府太学/国子监，堪称“太学正统”；同时作为中国近代第一所正式设立的大学、第一所国立大学和最早的教育部，开创了中国现代学制，以及最早的文科、理科、商科、法政科、农科等大学学科，奠基了中国近现代高等教育，堪称“新学祖庭”，历史地位无校可匹。而清华呢，最初是留美预备学校，是在输送学生赴美留学前提供预备教育。
