“引用参考文献不算查重。 论文检测系统会设置一个阈值，一般单篇文献引用率低于3%是检测不出来的。高于3%的，算作重复率。而且作者引用文献要写格式正确，格式不对就算作重复率。复检相当于匹配过程，以周期为单位。如果一个句子与其他文档重复，很容易被判断为重复。
论文写作时，参考文献部分是不算在查重范围内的，但是在正文部分所引用的文献内容是需要进行查重的。
因为写合格的毕业论文并不容易，所以学生们在写毕业论文的过程中去图书馆查阅大量的文献资料和网络文献，通过学习别人的意见和内容来完成自己的毕业论文，这样写的毕业论文和别人的论文多少有相同或相似之处，论文检测系统通过论文之间的比较，根据计算机算法计算的相似比，即论文的重复率。查重率只要不超过学校要求的标准，那么我们的论文就是合格的。
学校一般进行论文检测时，有些大学需要检查论文的全部内容，包括前言、摘要、目录、正文等，有些大学只需要检查正文。是不检测论文封面、目录、参考文献、引用、致谢等的。
论文查重官方称之为：学术不端检测，是为了打击学术论文剽窃、抄袭等不良风气，营造良好的积极向上的学术氛围，这些年由于一些知名人物频繁被曝出存在学术不端行为，造成了极其恶劣的影响。国家对于学术不端行为的管控也更加严格了，各大高校、出版社等机构单位也积极响应，出台了一系列措施，部分高校规定的论文重复率标准也由原来的30%直接降到了10%，甚至更低。