参公单位和机关单位的区别是：
一、名称不同：
1、参公单位的全称是参照公务员法管理事业单位
2、机关单位一般指党政及司法机关
二、本质不同
参公单位是事业单位，机关单位是行政单位
事业单位是国家机关依据法律法规设立的从事教育、科技、文化、卫生等活动的社会服务组织。事业单位一般要接受国家行政机关的领导，从目前情况来看，事业单位绝大部分由国家出资建立，大多为行政单位的下属机构。与企业相比，事业单位有以下特征：一是不以盈利为目的;二是财政及其他单位拨入的资金主要不以经济利益的获取为回报。
行政单位是工资薪水由国家财政发放，行使管理国家职能，三者缺一不可。
拓展资料：
1.参公单位和机关单位的联系：
参公人员录用、考核、晋级、工资待遇、福利与本地区公务员基本相同，享受《中华人民共和国公务员法》规定的权利和利益，受《中华人民共和国公务员法》约束。可见，参公身份是介于行政编制和普通事业编制之间的一种特殊事业编制身份。
2.行政编制的单位举例如外交部、税务局、海关、出入境检验检疫局等多为行政编制，属于公务员招录单位。
参照管理单位主要有气象局、国家统计局、证监会、银监会、保监会、地震局、中国工程院、国务院发展研究中心等。
两者皆有：有的单位招录会同时招行政编和参照管理单位，如2014年国家公务员招录，公安部、水利部、财政部、农业部等，既有行政编制的公务员，也有参照公务员法管理事业单位，根据具体的工作来定。
参考资料：中国人大-《中华人民共和国公务员法》
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