两所学校各有各的特点和优势，要根据自己的志向来选择，下面介绍一下二者的主要特点和区别：
一、特点不同
1、菏泽学院
菏泽学院是一所全日制普通本科高校，入选数据中国“百校工程”项目建设院校。菏泽学院的前身是创建于1949年的冀鲁豫区第二师范学校，2002年，菏泽师范专科学校、菏泽教育学院、菏泽广播电视大学3所学校合并，同时并入菏泽师范学校、菏泽农业学校，筹建菏泽学院。2004年，教育部正式批准更名为菏泽学院。2011年，单县幼儿师范学校、郓城幼儿师范学校并入菏泽学院。2017年，学校成为省级硕士培育建设单位。
2、枣庄学院
枣庄学院是山东省属公办全日制普通本科高校，入选数据中国“百校工程”项目院校。学校前身为1971年建立的枣庄市教师进修学校，1984年经山东省人民政府批准成立枣庄师范专科学校，2004年5月经教育部批准改建为全日制普通本科院校，更名为枣庄学院。2017年，学校成为省级硕士立项建设单位。
二、主要院系不同
1、菏泽学院
截至2020年，学校拥有21个二级学院、2个分校和东校区教学部，开办本科专业63个，涉及文学、历史学、经济学、法学、理学、工学、农学、教育学、管理学、艺术学10大学科门类。
2、枣庄学院
截至2020年，学校设有枣庄学院文学院、枣庄学院政治与社会发展学院、枣庄学院外国语学院、枣庄学院数学与统计学院、枣庄学院机电工程学院、枣庄学院光电工程学院、枣庄学院化学化工与材料科学学院、枣庄学院生命科学学院、枣庄学院旅游与资源环境学院、枣庄学院体育学院、枣庄学院音乐与舞蹈学院、枣庄学院美术与艺术设计学院等22个教学院（部）。开办普通本科专业57个，专科专业38个。
三、师资力量不同
1、菏泽学院
截至2020年，菏泽学院现有教职工1537人，专任教师1052人，具有硕士、博士学位的专任教师765人，具有高级职称的专任教师392人。教师中全国优秀科技工作者1人、享受国务院政府特殊津贴的专家1人、教育部大学生物学课程教学指导委员会委员1人，山东省有突出贡献的中青年专家3人、高等学校重点学科首席专家2人、本科教育教学指导委员会委员1人，山东省高校教学名师10人、优秀教学团队3个。“海智专家”37名。
2、枣庄学院
截至2020年，学校有教职工1206人，专任教师852人，教授67人、副教授252人，博士254人。拥有双聘院士1人、国家“百千万人才工程”专家人选1人，山东省及枣庄市“有突出贡献中青年专家”23人，省级教学名师、省级重点学科首席专家等7人，外籍教师9人，专兼职博士生导师、硕士生导师30余人，山东省首批“高校黄大年式教师团队”1个。
四、学校规模不同
1、菏泽学院
截至2020年，学校建有4个校区，占地面积1436亩，建筑面积57.74万平方米，共有全日制本专科在校生21583人，继续教育在读生2575人，有教职工1564人，专任教师1090人。
2、枣庄学院
截至2020年，学校占地1142亩，校舍面积41万平方米，有专任教师852人，全日制普通本专科在校生19000余人。
参考资料来源：百度百科-菏泽学院
参考资料来源：百度百科-枣庄学院
菏泽学院更好一些，学校的应用化学、物理是省级重点学科。
菏泽学院（Heze University）位于山东省菏泽市，是一所全日制普通本科高校，是数据中国“百校工程”项目建设院校。
学校建有4个校区，占地面积1436亩，建筑面积57.31万平方米，教学科研仪器设备总值1.75亿元，馆藏纸质图书215.74万册、期刊800余种。
师资力量
截至2019年4月，菏泽学院现有教职工1537人，专任教师1052人，具有硕士、博士学位的专任教师765人，具有高级职称的专任教师392人。
教师中全国优秀科技工作者1人、享受国务院政府特殊津贴的专家1人、教育部大学生物学课程教学指导委员会委员1人，山东省有突出贡献的中青年专家3人、高等学校重点学科首席专家2人、本科教育教学指导委员会委员1人，山东省高校教学名师10人、优秀教学团队3个。“海智专家”37名。
以上内容参考 百度百科-菏泽学院
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