不会直接扣分
骑摩托车的人有摩托车驾驶证，这时候和汽车驾驶证没有关系，各管各。摩托车违章就扣摩托车驾驶证的分。
摩托车上路首先需要参加交警部门许可的摩托车驾驶学习并获得D证（三轮摩托证）或E证（两轮摩托车证）。然后买摩托车要交购置税和办理保险，然后办理机动车牌子，并得到机动车行驶证和机动车登记证书。 摩托车要办证，在所属城市的车管所。
二轮摩托车、轻便摩托车车辆行驶证必须有车辆管理机关的检验合格签章记录，办理通行证时由工作人员查阅档案比对。二轮摩托车办证时应出具养路费缴讫凭证以及投保第三者责任险的单据。
本回答被网友采纳不会直接扣分。电子眼拍闯红灯只能识别车辆牌照，并不能识别驾驶员，所以不会随便扣车主的驾照分，也行骑车的另有其人呢。这时候就要看去处理该违章的骑车人有什么驾驶证决定处罚情况了。
两种情况：
一、骑摩托车的人有摩托车驾驶证，这时候和汽车驾驶证没有关系，各管各。摩托车违章就扣摩托车驾驶证的分。
二、骑摩托车的人没有摩托车驾驶证，只有汽车驾驶证；这时候就有关系了，属于准驾不符，汽车驾照会被扣12分。
《交通违法行为记分分值》规定
机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记12分：
（一）驾驶与准驾车型不符的机动车的；
（二）饮酒后驾驶机动车的；
（三）驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数20％以上的；
（四）造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（五）上道路行驶的机动车未悬挂机动车号牌的，或者故意遮挡、污损、不按规定安装机动车号牌的；
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