第1期：女神保卫战（真假雅典娜）
第一期
内容简介：范冰冰与Angelababy化身雅典娜女神，其余艺人则以圣斗士造型亮相，坐着铜马车、顶着“拯救地球”的主题。“照镜子”游戏环节中，两队分别做出动作，之后由对手还原。撕名牌环节采用经典的“老鹰捉小鸡”游戏。
分队情况：
①黄队：邓超（Out）、郑恺（Out）、王祖蓝（Out）、范冰冰、韩庚（胜利）
②蓝队：Angelababy（杨颖）（Out）、李晨（Out）、陈赫（Out）、包贝尔（Out）
第2期：超体元素保卫战
第二期
内容简介：“奔跑团”们化身沉睡了百年的R组织特工，为了守护能换来永久和平的“超体武器”，既要破解各种难题，又要与“霸道总裁”黄晓明斗智斗勇。
分队情况：
①R组织：邓超（Out 2次）、Angelababy（杨颖）、包贝尔（Out）、陈赫（Out）、李晨（Out）（胜利）
②Boss：黄晓明
③内奸：郑恺、王祖蓝（Out）（内奸在游戏环节属R组织）
第3期：R神之战
第三期
内容简介：欧弟、宋佳兵分三派通过“水上保龄”等游戏争夺“R神”之位。
分队情况：
①神算派（绿队）：邓超（Out 2次）、王祖蓝（Out 2次）、包贝尔（Out 4次）
②神指派（红队）：Angelababy（杨颖）（Out 1次）、郑恺（Out 2次）、欧弟（Out 1次）
③神洗派（蓝队）：李晨、陈赫、宋佳（Out 3次）（胜利）
第4期：大叔决战花美男
第四期
内容简介：此次“跑男团”登场打出“复古cosplay”牌，李晨身着蓝色西装外套，黑白格西裤演绎上世纪八十年代下海商人，以复古舞蹈秀颠覆亮相。本期《奔跑吧兄弟》再次走进校园，在杭州电子科技大学进行人气对抗赛。
分队情况：
①大叔队：邓超（Out）、陈赫（Out）、王祖蓝（Out）、李晨（Out 2次）、郑恺（Out）、包贝尔（Out 2次）（胜利）
②花美男队：Angelababy（杨颖）（Out）、林更新（Out 2次）、张艺兴（Out 2次）、叶祖新（Out 2次）、李治廷（Out）、蒋劲夫（Out 2次）
第5期：东厂大战锦衣卫
第五期
内容简介：“跑男团”们身穿飞鱼服、腰佩绣春刀，化身成明朝的“锦衣卫”和“厂公”行走于大内紫禁，两个特工组织进行对决，决出最后的胜利组织。
分队情况：
①东厂队：邓超（Out）、王祖蓝（Out）、包贝尔（Out）、杜淳（Out）、吴奇隆（Out，在锦衣卫队的内奸）
②锦衣卫队：Angelababy（杨颖）（在东厂的内奸）、李晨、陈赫（Out）、郑恺（Out）、陈乔恩（Out）（胜利）
注：中国内地男演员何中华特别出演皇帝。
第6期：寻找X乐章
第六期
内容简介：萧敬腾、信、姚晨、邓超四人将变身“音乐导师”带领“跑男团”与董成鹏、吉克隽逸一起找寻线索破解神秘的“X乐章”。
分队情况：
①邓超组（绿队）：邓超（Out）、吉克隽逸（Out）、大鹏（董成鹏）（Out）
②萧敬腾组（黄队）：萧敬腾、王祖蓝（Out）、郑恺（胜利）
③苏见信组（粉队）：信（苏见信）（Out）、Angelababy（杨颖）（Out）、陈赫（Out）
④姚晨组（蓝队）：姚晨（Out）、李晨（Out 1次，后复活到黄队）、包贝尔（Out）
第7期：拯救巨婴大作战
第七期
内容简介：“跑男团”与“辣妈”刘涛纷纷变身成了“萌萌哒”“巨婴”，玩起了“奔跑”史上萌值最高的游戏。
分队情况：
①黄队：邓超（Out）、Angelababy（杨颖）、郑恺（Out）、王祖蓝（Out）
②红队：李晨（Out）、陈赫、包贝尔（Out）、刘涛（胜利）
注：梁嘉鸿（2010年广州亚运会男子4×100米接力中国队成员）和陈宝（2010年广州健美锦标赛65公斤级冠军）特别出演
固定主持：邓超、Angelababy（杨颖）、李晨、陈赫、郑恺、王祖蓝、包贝尔
节目嘉宾：刘涛、王诗龄
播出时间：2015-05-29
拍摄地：广东广州
第8期：不能说的秘密
第八期
内容简介：节目中，“跑男队长”邓超再度化身“神秘人”接受了“不能说的秘密任务”，要在不暴露其秘密身份的情况下淘汰掉其他“奔跑团”成员。
分队情况：
①碟中谍：Angelababy（杨颖）（Out）、李晨（Out）、陈赫（Out）、郑恺（Out）、王祖蓝（Out）、包贝尔（Out）（胜利）
②间谍：邓超
固定主持：邓超、Angelababy（杨颖）、李晨、陈赫、郑恺、王祖蓝、包贝尔
节目嘉宾：无
播出时间：2015-06-05
拍摄地：北京顺义
剧情影视：《碟中谍》
第9期：“野蛮女友”特辑
第九期
内容简介：在《甄嬛传》里扮演“华妃”、“皇后”的蒋欣、蔡少芬和在《回家的诱惑》里扮演“艾莉”的李彩桦、《二次曝光》里的反派闺蜜霍思燕以及江一燕、Angelababy六位“野蛮女友”与六位“奔跑团”互相搭档，展开了“奔跑”史上女嘉宾最多的一场搭档竞技赛。
分队情况：
①深蓝队：邓超（Out）、江一燕（Out）
②橙队：Angelababy（杨颖）（Out）、郑恺（Out）
③绿队：陈赫（Out）、蒋欣（Out）
④粉队：王祖蓝、蔡少芬（Out）（胜利）
⑤天蓝队：李晨（Out）、霍思燕（Out）
⑥黄队：包贝尔（Out）、李彩桦（Out）
固定主持：邓超、Angelababy（杨颖）、李晨、陈赫、郑恺、王祖蓝、包贝尔
节目嘉宾：蔡少芬、霍思燕、李彩桦、蒋欣、江一燕
播出时间：2015-06-12
拍摄地：北京石景山区
剧情影视：《我的野蛮女友》
第10期：古镇奇遇记（敦煌大劫案续集）
第十期
内容简介：延续上一季西域通商满载而归的剧情，“奔跑商团”夜宿古镇再起风波。货物神秘失踪后，“南洋商队”以压倒性的颜值帅气现身。
分队情况：
①西域商队：邓超（Out）、Angelababy（杨颖）（Out）、李晨（Out）、郑恺（Out）
②南洋商队：陈赫（Out）、包贝尔（Out）、钟汉良（Out）、白百何、井柏然（Out）（胜利）
固定主持：邓超、Angelababy（杨颖）、李晨、陈赫、郑恺、王祖蓝、包贝尔
节目嘉宾：钟汉良、白百何、井柏然
播出时间：2015-06-19
拍摄地：北京密云县
剧情影视：《捉妖记》
第11期：快乐假期，噩梦假期（上）
第十一期
内容简介：两位美女“导游”唐嫣和柳岩带领跑男团一起来到了著名的度假胜地塞班岛，在这里度过了一次完美的“塞班假期”。
分队情况：
①绿队：Angelababy（杨颖）、郑恺、陈赫
②黄队：邓超、包贝尔、柳岩
③红队：李晨、王祖蓝、唐嫣（胜利）
固定主持：邓超、Angelababy（杨颖）、李晨、陈赫、郑恺、王祖蓝、包贝尔
节目嘉宾：唐嫣、柳岩
播出时间：2015-06-26
拍摄地：美国塞班岛
第12期：快乐假期，噩梦假期（下）
第十二期
内容简介：因“导游”唐嫣和柳岩的好奇心，兄弟们开始了第二季的个人“强者战”。
分队情况：
①邓超（Out）
②Angelababy（杨颖）（Out ）
③李晨（Out）
④陈赫（Out）
⑤郑恺（胜利）
⑥王祖蓝（Out）
⑦包贝尔（Out）
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