目前认为真核生物起源于和有氧呼吸的细菌共生的古菌。共生的细菌后来逐渐演化成了线粒体，专门负责有氧呼吸。所以线粒体也是有遗传物质的。
而且还没结束，虽然按理说真核细胞的主体是古菌，但是真核生物的基因更多来自细菌... 于是，目前认为这些细菌的基因正是来自线粒体。某种意义上... 线粒体才是本体...
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另外有一部分真核生物又和光合细菌共生成了原色素生物，这里面就有植物。共生的光合细菌逐渐演化成了色素体，对于绿色植物来说就是叶绿体。
这些源自细菌的细胞器都是双层膜结构，而其它的细胞器是由古菌细胞膜内层褶皱演化来的，是单层膜结构。
故事依然没有结束。又有一部份真核生物和原色素生物共生，然后共生的原色素生物又演化成了色素体，这种色素体是四层膜的。而这种真核生物称为褐藻。我们吃的海带和紫菜都属于这类生物。褐藻不是植物，最大的区别就是色素体有四层膜，植物只有两层。
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