南昌最好的民办大学排名如下：
江西科技学院、南昌理工学院、南昌工学院。
1、江西科技学院
江西科技学院是一所以工学、管理学、艺术学为主，多学科协调发展的全日制民办普通本科高校，具有颁发国家承认的统招本、专科学历资格，并具有学士学位授予权。
学校前身是创建于1994年的江西省高级职业学校，1999年经教育部批准成为普通高职院校，改名为蓝天职业技术学院，2005年升格为普通本科院校，改名江西蓝天学院，2009年获批为学士学位授予单位，2012年更名为江西科技学院。
2、南昌理工学院
南昌理工学院是经教育部批准设置的民办普通本科（二本）高校。1999年5月创建；2001年4月，经江西省人民政府批准升格为高职院校，定名为江西航天科技职业学院；2005年5月，经教育部批准升格为江西省首批民办本科高校，定名为南昌理工学院；
2009年4月，经江西省人民政府学位委员会批准为江西省首批民办高校学士学位授予单位；2012年11月，学校顺利通过教育部本科教学合格评估，是江西省首批第一所一次性通过合格评估的民办高校，专家组一致评价：南昌理工学院是民办教育的一面旗帜；
2016年4月，学校与华东交通大学开始联合培养研究生；2017年4月，被江西省人民政府学位委员会列为“十三五”硕士授权立项建设单位；2018年2月，被教育部命名为国防教育特色学校；
2018年11月，顺利通过了教育部本科教学工作审核评估，专家组一致认为：南昌理工学院是全国示范性民办高校，国防教育特色鲜明，军魂育人成效显著。2021年，被江西省人民政府学位委员会列为“十四五”硕士授权立项建设单位。
3、南昌工学院
南昌工学院是一所以工为主、多学科协调发展的全日制应用型本科院校。学校前身是中共七大代表、江西省委原书记傅雨田等一批老同志创办于1988年的民办赣江大学。1998年学校更名为赣江专修学院。
2003年学校更名为江西赣江职业技术学院，同年被教育部选定为“全国高校民族预科教育基地”；2011年4月，经教育部和江西省人民政府批准，在江西赣江职业技术学院的基础上设立南昌工学院，成为普通本科院校。2017年学校顺利通过教育部本科教学工作合格评估。
2021年学校被列入硕士学位授予建设单位。学校现为教育部首批1+X证书制度试点院校、江西省人民政府首批“向应用型高校转型发展试点院校”，中国社会组织评估5A等级院校。